Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Lamc3Q9R0B6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Lamc3Q9R0B6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Lamc3Q9R0B6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Lamc3Q9R0B6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
Lamc3Q9R0B6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Lamc3Q9R0B6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Lamc3Q9R0B6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Lamc3Q9R0B6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Lamc3Q9R0B6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Lamc3Q9R0B6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Lamc3Q9R0B6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Lamc3Q9R0B6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Lamc3Q9R0B6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Lamc3Q9R0B6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Lamc3Q9R0B6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Lamc3Q9R0B6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Lamc3Q9R0B6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Lamc3Q9R0B6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
Lamc3Q9R0B6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Lamc3Q9R0B6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Lamc3Q9R0B6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Lamc3Q9R0B6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Lamc3Q9R0B6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Lamc3Q9R0B6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Lamc3Q9R0B6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Lamc3Q9R0B6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Lamc3Q9R0B6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
Lamc3Q9R0B6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Lamc3Q9R0B6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
Lamc3Q9R0B6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Lamc3Q9R0B6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Lamc3Q9R0B6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Lamc3Q9R0B6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Lamc3Q9R0B6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Lamc3Q9R0B6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Lamc3Q9R0B6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Lamc3Q9R0B6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Lamc3Q9R0B6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Lamc3Q9R0B6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Lamc3Q9R0B6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Lamc3Q9R0B6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Lamc3Q9R0B6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Lamc3Q9R0B6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Lamc3Q9R0B6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Lamc3Q9R0B6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Lamc3Q9R0B6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Lamc3Q9R0B6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Lamc3Q9R0B6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Lamc3Q9R0B6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Lamc3Q9R0B6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Lamc3Q9R0B6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Lamc3Q9R0B6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Lamc3Q9R0B6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Lamc3Q9R0B6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Lamc3Q9R0B6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Lamc3Q9R0B6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Lamc3Q9R0B6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Lamc3Q9R0B6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Lamc3Q9R0B6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Lamc3Q9R0B6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Lamc3Q9R0B6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Lamc3Q9R0B6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Lamc3Q9R0B6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Lamc3Q9R0B6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Lamc3Q9R0B6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Lamc3Q9R0B6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Lamc3Q9R0B6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Lamc3Q9R0B6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Lamc3Q9R0B6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Lamc3Q9R0B6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
Lamc3Q9R0B6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Lamc3Q9R0B6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Lamc3Q9R0B6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Lamc3Q9R0B6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Lamc3Q9R0B6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Lamc3Q9R0B6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Lamc3Q9R0B6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Lamc3Q9R0B6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Lamc3Q9R0B6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
Lamc3Q9R0B6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Lamc3Q9R0B6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Lamc3Q9R0B6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Lamc3Q9R0B6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Lamc3Q9R0B6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
Lamc3Q9R0B6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Lamc3Q9R0B6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Lamc3Q9R0B6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Lamc3Q9R0B6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Lamc3Q9R0B6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
Lamc3Q9R0B6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Lamc3Q9R0B6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.14
Lamc3Q9R0B6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
Lamc3Q9R0B6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
Lamc3Q9R0B6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Lamc3Q9R0B6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
Lamc3Q9R0B6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Lamc3Q9R0B6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Lamc3Q9R0B6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Lamc3Q9R0B6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms