Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nek3Q9R0A5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nek3Q9R0A5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nek3Q9R0A5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nek3Q9R0A5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nek3Q9R0A5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nek3Q9R0A5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nek3Q9R0A5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nek3Q9R0A5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Nek3Q9R0A5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nek3Q9R0A5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nek3Q9R0A5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nek3Q9R0A5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nek3Q9R0A5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nek3Q9R0A5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nek3Q9R0A5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nek3Q9R0A5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Nek3Q9R0A5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nek3Q9R0A5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nek3Q9R0A5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nek3Q9R0A5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nek3Q9R0A5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nek3Q9R0A5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nek3Q9R0A5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nek3Q9R0A5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nek3Q9R0A5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nek3Q9R0A5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nek3Q9R0A5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nek3Q9R0A5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nek3Q9R0A5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nek3Q9R0A5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nek3Q9R0A5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nek3Q9R0A5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nek3Q9R0A5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nek3Q9R0A5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nek3Q9R0A5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nek3Q9R0A5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nek3Q9R0A5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nek3Q9R0A5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nek3Q9R0A5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nek3Q9R0A5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nek3Q9R0A5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nek3Q9R0A5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nek3Q9R0A5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nek3Q9R0A5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nek3Q9R0A5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Nek3Q9R0A5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nek3Q9R0A5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nek3Q9R0A5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nek3Q9R0A5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nek3Q9R0A5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nek3Q9R0A5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nek3Q9R0A5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nek3Q9R0A5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nek3Q9R0A5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nek3Q9R0A5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nek3Q9R0A5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nek3Q9R0A5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nek3Q9R0A5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nek3Q9R0A5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nek3Q9R0A5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nek3Q9R0A5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nek3Q9R0A5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nek3Q9R0A5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nek3Q9R0A5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nek3Q9R0A5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nek3Q9R0A5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nek3Q9R0A5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nek3Q9R0A5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nek3Q9R0A5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nek3Q9R0A5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nek3Q9R0A5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nek3Q9R0A5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nek3Q9R0A5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nek3Q9R0A5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Nek3Q9R0A5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nek3Q9R0A5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nek3Q9R0A5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nek3Q9R0A5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nek3Q9R0A5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nek3Q9R0A5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nek3Q9R0A5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nek3Q9R0A5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nek3Q9R0A5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nek3Q9R0A5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nek3Q9R0A5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nek3Q9R0A5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nek3Q9R0A5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Nek3Q9R0A5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nek3Q9R0A5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nek3Q9R0A5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nek3Q9R0A5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nek3Q9R0A5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Nek3Q9R0A5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nek3Q9R0A5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Nek3Q9R0A5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nek3Q9R0A5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nek3Q9R0A5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nek3Q9R0A5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nek3Q9R0A5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms