Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rnf4Q9QZS2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rnf4Q9QZS2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rnf4Q9QZS2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rnf4Q9QZS2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rnf4Q9QZS2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rnf4Q9QZS2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rnf4Q9QZS2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rnf4Q9QZS2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rnf4Q9QZS2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Rnf4Q9QZS2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rnf4Q9QZS2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rnf4Q9QZS2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rnf4Q9QZS2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rnf4Q9QZS2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rnf4Q9QZS2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rnf4Q9QZS2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rnf4Q9QZS2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rnf4Q9QZS2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rnf4Q9QZS2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnf4Q9QZS2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnf4Q9QZS2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnf4Q9QZS2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnf4Q9QZS2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnf4Q9QZS2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnf4Q9QZS2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnf4Q9QZS2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnf4Q9QZS2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnf4Q9QZS2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnf4Q9QZS2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnf4Q9QZS2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnf4Q9QZS2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnf4Q9QZS2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnf4Q9QZS2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnf4Q9QZS2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnf4Q9QZS2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnf4Q9QZS2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rnf4Q9QZS2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rnf4Q9QZS2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rnf4Q9QZS2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rnf4Q9QZS2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rnf4Q9QZS2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Rnf4Q9QZS2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rnf4Q9QZS2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rnf4Q9QZS2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rnf4Q9QZS2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rnf4Q9QZS2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rnf4Q9QZS2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rnf4Q9QZS2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rnf4Q9QZS2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rnf4Q9QZS2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rnf4Q9QZS2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rnf4Q9QZS2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rnf4Q9QZS2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rnf4Q9QZS2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rnf4Q9QZS2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rnf4Q9QZS2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rnf4Q9QZS2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rnf4Q9QZS2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rnf4Q9QZS2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rnf4Q9QZS2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rnf4Q9QZS2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rnf4Q9QZS2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rnf4Q9QZS2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Rnf4Q9QZS2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rnf4Q9QZS2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rnf4Q9QZS2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rnf4Q9QZS2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rnf4Q9QZS2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rnf4Q9QZS2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rnf4Q9QZS2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rnf4Q9QZS2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rnf4Q9QZS2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rnf4Q9QZS2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rnf4Q9QZS2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rnf4Q9QZS2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rnf4Q9QZS2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rnf4Q9QZS2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rnf4Q9QZS2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rnf4Q9QZS2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rnf4Q9QZS2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rnf4Q9QZS2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rnf4Q9QZS2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rnf4Q9QZS2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rnf4Q9QZS2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rnf4Q9QZS2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rnf4Q9QZS2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rnf4Q9QZS2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rnf4Q9QZS2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rnf4Q9QZS2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rnf4Q9QZS2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rnf4Q9QZS2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rnf4Q9QZS2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rnf4Q9QZS2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rnf4Q9QZS2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rnf4Q9QZS2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rnf4Q9QZS2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rnf4Q9QZS2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rnf4Q9QZS2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rnf4Q9QZS2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms