Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Npas3Q9QZQ0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Npas3Q9QZQ0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Npas3Q9QZQ0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Npas3Q9QZQ0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Npas3Q9QZQ0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Npas3Q9QZQ0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Npas3Q9QZQ0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Npas3Q9QZQ0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Npas3Q9QZQ0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Npas3Q9QZQ0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Npas3Q9QZQ0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Npas3Q9QZQ0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Npas3Q9QZQ0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Npas3Q9QZQ0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Npas3Q9QZQ0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Npas3Q9QZQ0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Npas3Q9QZQ0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Npas3Q9QZQ0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Npas3Q9QZQ0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Npas3Q9QZQ0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Npas3Q9QZQ0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Npas3Q9QZQ0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Npas3Q9QZQ0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Npas3Q9QZQ0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Npas3Q9QZQ0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Npas3Q9QZQ0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Npas3Q9QZQ0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Npas3Q9QZQ0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Npas3Q9QZQ0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Npas3Q9QZQ0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Npas3Q9QZQ0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Npas3Q9QZQ0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Npas3Q9QZQ0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Npas3Q9QZQ0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Npas3Q9QZQ0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Npas3Q9QZQ0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Npas3Q9QZQ0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Npas3Q9QZQ0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Npas3Q9QZQ0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Npas3Q9QZQ0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Npas3Q9QZQ0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Npas3Q9QZQ0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Npas3Q9QZQ0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Npas3Q9QZQ0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Npas3Q9QZQ0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Npas3Q9QZQ0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Npas3Q9QZQ0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Npas3Q9QZQ0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Npas3Q9QZQ0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Npas3Q9QZQ0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Npas3Q9QZQ0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Npas3Q9QZQ0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Npas3Q9QZQ0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Npas3Q9QZQ0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Npas3Q9QZQ0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Npas3Q9QZQ0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Npas3Q9QZQ0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Npas3Q9QZQ0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Npas3Q9QZQ0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Npas3Q9QZQ0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Npas3Q9QZQ0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Npas3Q9QZQ0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Npas3Q9QZQ0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Npas3Q9QZQ0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Npas3Q9QZQ0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Npas3Q9QZQ0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Npas3Q9QZQ0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Npas3Q9QZQ0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Npas3Q9QZQ0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Npas3Q9QZQ0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Npas3Q9QZQ0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Npas3Q9QZQ0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Npas3Q9QZQ0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Npas3Q9QZQ0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Npas3Q9QZQ0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Npas3Q9QZQ0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Npas3Q9QZQ0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Npas3Q9QZQ0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Npas3Q9QZQ0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Npas3Q9QZQ0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Npas3Q9QZQ0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Npas3Q9QZQ0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Npas3Q9QZQ0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Npas3Q9QZQ0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Npas3Q9QZQ0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Npas3Q9QZQ0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Npas3Q9QZQ0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Npas3Q9QZQ0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Npas3Q9QZQ0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Npas3Q9QZQ0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Npas3Q9QZQ0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Npas3Q9QZQ0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Npas3Q9QZQ0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Npas3Q9QZQ0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Npas3Q9QZQ0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Npas3Q9QZQ0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Npas3Q9QZQ0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Npas3Q9QZQ0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Npas3Q9QZQ0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms