Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME9

Vstm2b, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2bQ9JME9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vstm2bQ9JME9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vstm2bQ9JME9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vstm2bQ9JME9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vstm2bQ9JME9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vstm2bQ9JME9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vstm2bQ9JME9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vstm2bQ9JME9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vstm2bQ9JME9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vstm2bQ9JME9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vstm2bQ9JME9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vstm2bQ9JME9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vstm2bQ9JME9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vstm2bQ9JME9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vstm2bQ9JME9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vstm2bQ9JME9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vstm2bQ9JME9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vstm2bQ9JME9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vstm2bQ9JME9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vstm2bQ9JME9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vstm2bQ9JME9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vstm2bQ9JME9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vstm2bQ9JME9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vstm2bQ9JME9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vstm2bQ9JME9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vstm2bQ9JME9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vstm2bQ9JME9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vstm2bQ9JME9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vstm2bQ9JME9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vstm2bQ9JME9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vstm2bQ9JME9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vstm2bQ9JME9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vstm2bQ9JME9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Vstm2bQ9JME9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vstm2bQ9JME9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vstm2bQ9JME9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vstm2bQ9JME9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Vstm2bQ9JME9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vstm2bQ9JME9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Vstm2bQ9JME9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vstm2bQ9JME9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vstm2bQ9JME9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vstm2bQ9JME9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vstm2bQ9JME9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vstm2bQ9JME9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Vstm2bQ9JME9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vstm2bQ9JME9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vstm2bQ9JME9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vstm2bQ9JME9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vstm2bQ9JME9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vstm2bQ9JME9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vstm2bQ9JME9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vstm2bQ9JME9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vstm2bQ9JME9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vstm2bQ9JME9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Vstm2bQ9JME9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vstm2bQ9JME9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vstm2bQ9JME9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vstm2bQ9JME9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vstm2bQ9JME9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vstm2bQ9JME9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vstm2bQ9JME9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vstm2bQ9JME9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vstm2bQ9JME9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vstm2bQ9JME9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vstm2bQ9JME9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vstm2bQ9JME9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vstm2bQ9JME9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vstm2bQ9JME9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vstm2bQ9JME9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vstm2bQ9JME9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vstm2bQ9JME9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vstm2bQ9JME9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vstm2bQ9JME9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vstm2bQ9JME9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vstm2bQ9JME9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vstm2bQ9JME9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vstm2bQ9JME9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vstm2bQ9JME9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vstm2bQ9JME9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vstm2bQ9JME9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vstm2bQ9JME9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vstm2bQ9JME9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vstm2bQ9JME9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vstm2bQ9JME9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vstm2bQ9JME9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vstm2bQ9JME9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Vstm2bQ9JME9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Vstm2bQ9JME9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vstm2bQ9JME9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vstm2bQ9JME9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vstm2bQ9JME9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vstm2bQ9JME9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vstm2bQ9JME9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vstm2bQ9JME9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vstm2bQ9JME9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vstm2bQ9JME9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vstm2bQ9JME9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vstm2bQ9JME9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vstm2bQ9JME9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 378.8 ms