Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sfmbt1Q9JMD1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sfmbt1Q9JMD1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sfmbt1Q9JMD1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sfmbt1Q9JMD1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sfmbt1Q9JMD1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sfmbt1Q9JMD1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sfmbt1Q9JMD1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sfmbt1Q9JMD1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sfmbt1Q9JMD1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sfmbt1Q9JMD1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sfmbt1Q9JMD1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sfmbt1Q9JMD1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sfmbt1Q9JMD1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sfmbt1Q9JMD1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sfmbt1Q9JMD1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sfmbt1Q9JMD1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sfmbt1Q9JMD1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sfmbt1Q9JMD1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sfmbt1Q9JMD1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sfmbt1Q9JMD1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sfmbt1Q9JMD1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sfmbt1Q9JMD1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sfmbt1Q9JMD1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sfmbt1Q9JMD1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sfmbt1Q9JMD1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sfmbt1Q9JMD1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sfmbt1Q9JMD1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sfmbt1Q9JMD1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sfmbt1Q9JMD1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sfmbt1Q9JMD1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sfmbt1Q9JMD1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sfmbt1Q9JMD1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Sfmbt1Q9JMD1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sfmbt1Q9JMD1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sfmbt1Q9JMD1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sfmbt1Q9JMD1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sfmbt1Q9JMD1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sfmbt1Q9JMD1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sfmbt1Q9JMD1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sfmbt1Q9JMD1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sfmbt1Q9JMD1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sfmbt1Q9JMD1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sfmbt1Q9JMD1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sfmbt1Q9JMD1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sfmbt1Q9JMD1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sfmbt1Q9JMD1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sfmbt1Q9JMD1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sfmbt1Q9JMD1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sfmbt1Q9JMD1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sfmbt1Q9JMD1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sfmbt1Q9JMD1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sfmbt1Q9JMD1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sfmbt1Q9JMD1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sfmbt1Q9JMD1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sfmbt1Q9JMD1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sfmbt1Q9JMD1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sfmbt1Q9JMD1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sfmbt1Q9JMD1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sfmbt1Q9JMD1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sfmbt1Q9JMD1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sfmbt1Q9JMD1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sfmbt1Q9JMD1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sfmbt1Q9JMD1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sfmbt1Q9JMD1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sfmbt1Q9JMD1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sfmbt1Q9JMD1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sfmbt1Q9JMD1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sfmbt1Q9JMD1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sfmbt1Q9JMD1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sfmbt1Q9JMD1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sfmbt1Q9JMD1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sfmbt1Q9JMD1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sfmbt1Q9JMD1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sfmbt1Q9JMD1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sfmbt1Q9JMD1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sfmbt1Q9JMD1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sfmbt1Q9JMD1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sfmbt1Q9JMD1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sfmbt1Q9JMD1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sfmbt1Q9JMD1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 396.8 ms