Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

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Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tgm1Q9JLF6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tgm1Q9JLF6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tgm1Q9JLF6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tgm1Q9JLF6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tgm1Q9JLF6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tgm1Q9JLF6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tgm1Q9JLF6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tgm1Q9JLF6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tgm1Q9JLF6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tgm1Q9JLF6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tgm1Q9JLF6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tgm1Q9JLF6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Tgm1Q9JLF6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tgm1Q9JLF6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tgm1Q9JLF6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tgm1Q9JLF6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Tgm1Q9JLF6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tgm1Q9JLF6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tgm1Q9JLF6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tgm1Q9JLF6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tgm1Q9JLF6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tgm1Q9JLF6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tgm1Q9JLF6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tgm1Q9JLF6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tgm1Q9JLF6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tgm1Q9JLF6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Tgm1Q9JLF6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tgm1Q9JLF6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tgm1Q9JLF6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tgm1Q9JLF6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tgm1Q9JLF6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tgm1Q9JLF6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tgm1Q9JLF6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tgm1Q9JLF6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tgm1Q9JLF6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Tgm1Q9JLF6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tgm1Q9JLF6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tgm1Q9JLF6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tgm1Q9JLF6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tgm1Q9JLF6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Tgm1Q9JLF6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tgm1Q9JLF6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tgm1Q9JLF6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Tgm1Q9JLF6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tgm1Q9JLF6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Tgm1Q9JLF6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tgm1Q9JLF6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Tgm1Q9JLF6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tgm1Q9JLF6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tgm1Q9JLF6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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Tgm1Q9JLF6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tgm1Q9JLF6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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Tgm1Q9JLF6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tgm1Q9JLF6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tgm1Q9JLF6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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Tgm1Q9JLF6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tgm1Q9JLF6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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Tgm1Q9JLF6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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Tgm1Q9JLF6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tgm1Q9JLF6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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Tgm1Q9JLF6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tgm1Q9JLF6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tgm1Q9JLF6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tgm1Q9JLF6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tgm1Q9JLF6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tgm1Q9JLF6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tgm1Q9JLF6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tgm1Q9JLF6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tgm1Q9JLF6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tgm1Q9JLF6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tgm1Q9JLF6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Tgm1Q9JLF6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tgm1Q9JLF6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tgm1Q9JLF6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tgm1Q9JLF6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tgm1Q9JLF6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Tgm1Q9JLF6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tgm1Q9JLF6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tgm1Q9JLF6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms