Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL16

Isg20, Interferon-stimulated gene 20 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Isg20Q9JL16 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Isg20Q9JL16 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Isg20Q9JL16 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Isg20Q9JL16 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Isg20Q9JL16 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Isg20Q9JL16 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Isg20Q9JL16 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Isg20Q9JL16 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Isg20Q9JL16 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Isg20Q9JL16 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Isg20Q9JL16 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Isg20Q9JL16 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Isg20Q9JL16 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Isg20Q9JL16 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Isg20Q9JL16 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Isg20Q9JL16 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Isg20Q9JL16 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Isg20Q9JL16 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Isg20Q9JL16 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Isg20Q9JL16 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Isg20Q9JL16 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Isg20Q9JL16 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Isg20Q9JL16 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Isg20Q9JL16 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Isg20Q9JL16 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Isg20Q9JL16 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Isg20Q9JL16 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Isg20Q9JL16 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Isg20Q9JL16 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Isg20Q9JL16 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Isg20Q9JL16 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Isg20Q9JL16 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Isg20Q9JL16 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Isg20Q9JL16 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Isg20Q9JL16 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Isg20Q9JL16 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Isg20Q9JL16 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Isg20Q9JL16 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Isg20Q9JL16 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Isg20Q9JL16 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Isg20Q9JL16 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Isg20Q9JL16 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Isg20Q9JL16 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Isg20Q9JL16 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Isg20Q9JL16 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Isg20Q9JL16 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Isg20Q9JL16 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Isg20Q9JL16 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Isg20Q9JL16 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Isg20Q9JL16 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Isg20Q9JL16 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Isg20Q9JL16 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Isg20Q9JL16 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Isg20Q9JL16 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Isg20Q9JL16 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Isg20Q9JL16 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Isg20Q9JL16 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Isg20Q9JL16 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Isg20Q9JL16 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Isg20Q9JL16 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Isg20Q9JL16 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Isg20Q9JL16 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Isg20Q9JL16 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Isg20Q9JL16 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Isg20Q9JL16 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Isg20Q9JL16 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Isg20Q9JL16 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Isg20Q9JL16 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Isg20Q9JL16 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Isg20Q9JL16 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Isg20Q9JL16 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Isg20Q9JL16 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Isg20Q9JL16 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Isg20Q9JL16 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Isg20Q9JL16 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Isg20Q9JL16 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Isg20Q9JL16 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Isg20Q9JL16 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Isg20Q9JL16 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Isg20Q9JL16 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Isg20Q9JL16 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Isg20Q9JL16 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Isg20Q9JL16 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Isg20Q9JL16 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Isg20Q9JL16 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Isg20Q9JL16 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Isg20Q9JL16 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Isg20Q9JL16 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Isg20Q9JL16 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Isg20Q9JL16 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Isg20Q9JL16 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Isg20Q9JL16 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Isg20Q9JL16 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Isg20Q9JL16 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Isg20Q9JL16 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Isg20Q9JL16 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Isg20Q9JL16 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Isg20Q9JL16 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Isg20Q9JL16 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Isg20Q9JL16 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms