Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cnot9Q9JKY0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cnot9Q9JKY0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cnot9Q9JKY0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cnot9Q9JKY0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cnot9Q9JKY0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnot9Q9JKY0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnot9Q9JKY0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnot9Q9JKY0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnot9Q9JKY0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnot9Q9JKY0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnot9Q9JKY0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnot9Q9JKY0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnot9Q9JKY0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnot9Q9JKY0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnot9Q9JKY0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cnot9Q9JKY0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cnot9Q9JKY0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cnot9Q9JKY0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cnot9Q9JKY0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cnot9Q9JKY0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cnot9Q9JKY0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cnot9Q9JKY0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Cnot9Q9JKY0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnot9Q9JKY0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnot9Q9JKY0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnot9Q9JKY0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnot9Q9JKY0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnot9Q9JKY0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnot9Q9JKY0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnot9Q9JKY0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnot9Q9JKY0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnot9Q9JKY0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnot9Q9JKY0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnot9Q9JKY0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnot9Q9JKY0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnot9Q9JKY0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnot9Q9JKY0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnot9Q9JKY0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnot9Q9JKY0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnot9Q9JKY0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnot9Q9JKY0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnot9Q9JKY0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnot9Q9JKY0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnot9Q9JKY0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnot9Q9JKY0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnot9Q9JKY0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnot9Q9JKY0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnot9Q9JKY0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnot9Q9JKY0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnot9Q9JKY0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnot9Q9JKY0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnot9Q9JKY0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnot9Q9JKY0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnot9Q9JKY0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnot9Q9JKY0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnot9Q9JKY0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnot9Q9JKY0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnot9Q9JKY0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnot9Q9JKY0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnot9Q9JKY0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnot9Q9JKY0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnot9Q9JKY0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnot9Q9JKY0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnot9Q9JKY0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnot9Q9JKY0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnot9Q9JKY0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnot9Q9JKY0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnot9Q9JKY0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnot9Q9JKY0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnot9Q9JKY0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnot9Q9JKY0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnot9Q9JKY0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnot9Q9JKY0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnot9Q9JKY0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnot9Q9JKY0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnot9Q9JKY0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnot9Q9JKY0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnot9Q9JKY0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnot9Q9JKY0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnot9Q9JKY0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnot9Q9JKY0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnot9Q9JKY0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnot9Q9JKY0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnot9Q9JKY0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnot9Q9JKY0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnot9Q9JKY0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnot9Q9JKY0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnot9Q9JKY0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnot9Q9JKY0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnot9Q9JKY0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnot9Q9JKY0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnot9Q9JKY0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnot9Q9JKY0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnot9Q9JKY0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnot9Q9JKY0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnot9Q9JKY0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnot9Q9JKY0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnot9Q9JKY0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnot9Q9JKY0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms