Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK0

Rcan3, Calcipressin-3, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcan3Q9JKK0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rcan3Q9JKK0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rcan3Q9JKK0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rcan3Q9JKK0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rcan3Q9JKK0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rcan3Q9JKK0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rcan3Q9JKK0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rcan3Q9JKK0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rcan3Q9JKK0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Rcan3Q9JKK0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rcan3Q9JKK0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rcan3Q9JKK0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rcan3Q9JKK0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rcan3Q9JKK0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rcan3Q9JKK0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Rcan3Q9JKK0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rcan3Q9JKK0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rcan3Q9JKK0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rcan3Q9JKK0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rcan3Q9JKK0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rcan3Q9JKK0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rcan3Q9JKK0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rcan3Q9JKK0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rcan3Q9JKK0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rcan3Q9JKK0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rcan3Q9JKK0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rcan3Q9JKK0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rcan3Q9JKK0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rcan3Q9JKK0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rcan3Q9JKK0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rcan3Q9JKK0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rcan3Q9JKK0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rcan3Q9JKK0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rcan3Q9JKK0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rcan3Q9JKK0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rcan3Q9JKK0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Rcan3Q9JKK0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rcan3Q9JKK0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rcan3Q9JKK0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rcan3Q9JKK0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rcan3Q9JKK0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rcan3Q9JKK0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rcan3Q9JKK0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rcan3Q9JKK0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rcan3Q9JKK0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rcan3Q9JKK0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rcan3Q9JKK0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Rcan3Q9JKK0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rcan3Q9JKK0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rcan3Q9JKK0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rcan3Q9JKK0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rcan3Q9JKK0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rcan3Q9JKK0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rcan3Q9JKK0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rcan3Q9JKK0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rcan3Q9JKK0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rcan3Q9JKK0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rcan3Q9JKK0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rcan3Q9JKK0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Rcan3Q9JKK0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rcan3Q9JKK0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rcan3Q9JKK0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rcan3Q9JKK0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rcan3Q9JKK0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rcan3Q9JKK0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rcan3Q9JKK0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rcan3Q9JKK0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rcan3Q9JKK0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rcan3Q9JKK0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rcan3Q9JKK0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rcan3Q9JKK0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rcan3Q9JKK0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rcan3Q9JKK0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rcan3Q9JKK0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rcan3Q9JKK0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rcan3Q9JKK0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rcan3Q9JKK0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rcan3Q9JKK0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rcan3Q9JKK0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rcan3Q9JKK0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rcan3Q9JKK0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rcan3Q9JKK0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rcan3Q9JKK0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Rcan3Q9JKK0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rcan3Q9JKK0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rcan3Q9JKK0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rcan3Q9JKK0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Rcan3Q9JKK0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rcan3Q9JKK0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rcan3Q9JKK0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rcan3Q9JKK0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rcan3Q9JKK0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rcan3Q9JKK0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rcan3Q9JKK0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rcan3Q9JKK0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rcan3Q9JKK0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rcan3Q9JKK0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rcan3Q9JKK0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rcan3Q9JKK0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rcan3Q9JKK0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms