Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nectin1Q9JKF6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nectin1Q9JKF6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nectin1Q9JKF6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nectin1Q9JKF6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nectin1Q9JKF6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nectin1Q9JKF6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nectin1Q9JKF6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nectin1Q9JKF6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Nectin1Q9JKF6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nectin1Q9JKF6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nectin1Q9JKF6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nectin1Q9JKF6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nectin1Q9JKF6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nectin1Q9JKF6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nectin1Q9JKF6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nectin1Q9JKF6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nectin1Q9JKF6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nectin1Q9JKF6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nectin1Q9JKF6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nectin1Q9JKF6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nectin1Q9JKF6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Nectin1Q9JKF6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nectin1Q9JKF6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nectin1Q9JKF6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nectin1Q9JKF6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Nectin1Q9JKF6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nectin1Q9JKF6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nectin1Q9JKF6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nectin1Q9JKF6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nectin1Q9JKF6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nectin1Q9JKF6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nectin1Q9JKF6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nectin1Q9JKF6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nectin1Q9JKF6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nectin1Q9JKF6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Nectin1Q9JKF6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nectin1Q9JKF6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nectin1Q9JKF6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nectin1Q9JKF6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nectin1Q9JKF6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nectin1Q9JKF6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nectin1Q9JKF6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nectin1Q9JKF6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nectin1Q9JKF6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nectin1Q9JKF6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nectin1Q9JKF6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nectin1Q9JKF6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nectin1Q9JKF6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nectin1Q9JKF6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nectin1Q9JKF6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nectin1Q9JKF6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nectin1Q9JKF6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nectin1Q9JKF6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nectin1Q9JKF6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nectin1Q9JKF6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nectin1Q9JKF6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Nectin1Q9JKF6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nectin1Q9JKF6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nectin1Q9JKF6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nectin1Q9JKF6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nectin1Q9JKF6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nectin1Q9JKF6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nectin1Q9JKF6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nectin1Q9JKF6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nectin1Q9JKF6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nectin1Q9JKF6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nectin1Q9JKF6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nectin1Q9JKF6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Nectin1Q9JKF6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nectin1Q9JKF6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nectin1Q9JKF6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nectin1Q9JKF6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Nectin1Q9JKF6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nectin1Q9JKF6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nectin1Q9JKF6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nectin1Q9JKF6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nectin1Q9JKF6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nectin1Q9JKF6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nectin1Q9JKF6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nectin1Q9JKF6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nectin1Q9JKF6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nectin1Q9JKF6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Nectin1Q9JKF6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nectin1Q9JKF6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nectin1Q9JKF6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nectin1Q9JKF6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nectin1Q9JKF6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nectin1Q9JKF6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nectin1Q9JKF6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nectin1Q9JKF6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nectin1Q9JKF6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nectin1Q9JKF6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nectin1Q9JKF6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nectin1Q9JKF6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nectin1Q9JKF6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nectin1Q9JKF6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nectin1Q9JKF6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nectin1Q9JKF6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nectin1Q9JKF6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms