Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK97

Kcnq4, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 4, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnq4Q9JK97 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnq4Q9JK97 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnq4Q9JK97 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnq4Q9JK97 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnq4Q9JK97 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnq4Q9JK97 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnq4Q9JK97 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnq4Q9JK97 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnq4Q9JK97 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnq4Q9JK97 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnq4Q9JK97 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnq4Q9JK97 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnq4Q9JK97 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnq4Q9JK97 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnq4Q9JK97 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcnq4Q9JK97 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcnq4Q9JK97 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcnq4Q9JK97 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcnq4Q9JK97 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcnq4Q9JK97 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcnq4Q9JK97 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcnq4Q9JK97 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcnq4Q9JK97 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcnq4Q9JK97 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcnq4Q9JK97 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcnq4Q9JK97 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcnq4Q9JK97 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcnq4Q9JK97 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcnq4Q9JK97 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcnq4Q9JK97 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcnq4Q9JK97 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcnq4Q9JK97 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnq4Q9JK97 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnq4Q9JK97 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnq4Q9JK97 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnq4Q9JK97 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnq4Q9JK97 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnq4Q9JK97 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnq4Q9JK97 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnq4Q9JK97 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnq4Q9JK97 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnq4Q9JK97 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnq4Q9JK97 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnq4Q9JK97 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnq4Q9JK97 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnq4Q9JK97 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnq4Q9JK97 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnq4Q9JK97 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnq4Q9JK97 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnq4Q9JK97 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnq4Q9JK97 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnq4Q9JK97 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnq4Q9JK97 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnq4Q9JK97 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnq4Q9JK97 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnq4Q9JK97 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnq4Q9JK97 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnq4Q9JK97 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnq4Q9JK97 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnq4Q9JK97 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnq4Q9JK97 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnq4Q9JK97 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnq4Q9JK97 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnq4Q9JK97 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnq4Q9JK97 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnq4Q9JK97 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnq4Q9JK97 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnq4Q9JK97 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnq4Q9JK97 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnq4Q9JK97 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnq4Q9JK97 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnq4Q9JK97 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnq4Q9JK97 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnq4Q9JK97 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnq4Q9JK97 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnq4Q9JK97 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnq4Q9JK97 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnq4Q9JK97 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnq4Q9JK97 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnq4Q9JK97 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnq4Q9JK97 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcnq4Q9JK97 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcnq4Q9JK97 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcnq4Q9JK97 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcnq4Q9JK97 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcnq4Q9JK97 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcnq4Q9JK97 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcnq4Q9JK97 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnq4Q9JK97 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnq4Q9JK97 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnq4Q9JK97 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnq4Q9JK97 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnq4Q9JK97 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnq4Q9JK97 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnq4Q9JK97 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnq4Q9JK97 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnq4Q9JK97 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnq4Q9JK97 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnq4Q9JK97 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnq4Q9JK97 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms