Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pard6bQ9JK83 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pard6bQ9JK83 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pard6bQ9JK83 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pard6bQ9JK83 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pard6bQ9JK83 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pard6bQ9JK83 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pard6bQ9JK83 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pard6bQ9JK83 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pard6bQ9JK83 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pard6bQ9JK83 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pard6bQ9JK83 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pard6bQ9JK83 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pard6bQ9JK83 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pard6bQ9JK83 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pard6bQ9JK83 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pard6bQ9JK83 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pard6bQ9JK83 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pard6bQ9JK83 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pard6bQ9JK83 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Pard6bQ9JK83 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Pard6bQ9JK83 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Pard6bQ9JK83 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Pard6bQ9JK83 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Pard6bQ9JK83 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pard6bQ9JK83 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pard6bQ9JK83 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pard6bQ9JK83 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pard6bQ9JK83 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pard6bQ9JK83 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pard6bQ9JK83 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pard6bQ9JK83 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pard6bQ9JK83 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pard6bQ9JK83 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pard6bQ9JK83 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pard6bQ9JK83 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Pard6bQ9JK83 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pard6bQ9JK83 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pard6bQ9JK83 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pard6bQ9JK83 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pard6bQ9JK83 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pard6bQ9JK83 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pard6bQ9JK83 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pard6bQ9JK83 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pard6bQ9JK83 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pard6bQ9JK83 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pard6bQ9JK83 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pard6bQ9JK83 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pard6bQ9JK83 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pard6bQ9JK83 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pard6bQ9JK83 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pard6bQ9JK83 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pard6bQ9JK83 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pard6bQ9JK83 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pard6bQ9JK83 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pard6bQ9JK83 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pard6bQ9JK83 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pard6bQ9JK83 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pard6bQ9JK83 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pard6bQ9JK83 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pard6bQ9JK83 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pard6bQ9JK83 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pard6bQ9JK83 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pard6bQ9JK83 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pard6bQ9JK83 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Pard6bQ9JK83 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pard6bQ9JK83 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pard6bQ9JK83 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pard6bQ9JK83 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pard6bQ9JK83 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pard6bQ9JK83 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pard6bQ9JK83 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pard6bQ9JK83 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pard6bQ9JK83 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pard6bQ9JK83 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pard6bQ9JK83 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pard6bQ9JK83 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pard6bQ9JK83 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pard6bQ9JK83 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pard6bQ9JK83 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pard6bQ9JK83 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pard6bQ9JK83 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pard6bQ9JK83 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pard6bQ9JK83 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pard6bQ9JK83 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pard6bQ9JK83 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pard6bQ9JK83 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pard6bQ9JK83 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pard6bQ9JK83 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pard6bQ9JK83 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pard6bQ9JK83 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pard6bQ9JK83 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pard6bQ9JK83 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pard6bQ9JK83 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pard6bQ9JK83 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pard6bQ9JK83 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Pard6bQ9JK83 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pard6bQ9JK83 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pard6bQ9JK83 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pard6bQ9JK83 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms