Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJG7

Caln1, Calcium-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caln1Q9JJG7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Caln1Q9JJG7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Caln1Q9JJG7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Caln1Q9JJG7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Caln1Q9JJG7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Caln1Q9JJG7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Caln1Q9JJG7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Caln1Q9JJG7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Caln1Q9JJG7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Caln1Q9JJG7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Caln1Q9JJG7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Caln1Q9JJG7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Caln1Q9JJG7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Caln1Q9JJG7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Caln1Q9JJG7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Caln1Q9JJG7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Caln1Q9JJG7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Caln1Q9JJG7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Caln1Q9JJG7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Caln1Q9JJG7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Caln1Q9JJG7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Caln1Q9JJG7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Caln1Q9JJG7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Caln1Q9JJG7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Caln1Q9JJG7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Caln1Q9JJG7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Caln1Q9JJG7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Caln1Q9JJG7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Caln1Q9JJG7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Caln1Q9JJG7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Caln1Q9JJG7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Caln1Q9JJG7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Caln1Q9JJG7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Caln1Q9JJG7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Caln1Q9JJG7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Caln1Q9JJG7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Caln1Q9JJG7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Caln1Q9JJG7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Caln1Q9JJG7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Caln1Q9JJG7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Caln1Q9JJG7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Caln1Q9JJG7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Caln1Q9JJG7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Caln1Q9JJG7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Caln1Q9JJG7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Caln1Q9JJG7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Caln1Q9JJG7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Caln1Q9JJG7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Caln1Q9JJG7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Caln1Q9JJG7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Caln1Q9JJG7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Caln1Q9JJG7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Caln1Q9JJG7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Caln1Q9JJG7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Caln1Q9JJG7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Caln1Q9JJG7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Caln1Q9JJG7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Caln1Q9JJG7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Caln1Q9JJG7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Caln1Q9JJG7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Caln1Q9JJG7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Caln1Q9JJG7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Caln1Q9JJG7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Caln1Q9JJG7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Caln1Q9JJG7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Caln1Q9JJG7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Caln1Q9JJG7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Caln1Q9JJG7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Caln1Q9JJG7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Caln1Q9JJG7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Caln1Q9JJG7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Caln1Q9JJG7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Caln1Q9JJG7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Caln1Q9JJG7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Caln1Q9JJG7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Caln1Q9JJG7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Caln1Q9JJG7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Caln1Q9JJG7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Caln1Q9JJG7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Caln1Q9JJG7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Caln1Q9JJG7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Caln1Q9JJG7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Caln1Q9JJG7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Caln1Q9JJG7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Caln1Q9JJG7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Caln1Q9JJG7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Caln1Q9JJG7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Caln1Q9JJG7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Caln1Q9JJG7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Caln1Q9JJG7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Caln1Q9JJG7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Caln1Q9JJG7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Caln1Q9JJG7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Caln1Q9JJG7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Caln1Q9JJG7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Caln1Q9JJG7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Caln1Q9JJG7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Caln1Q9JJG7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Caln1Q9JJG7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Caln1Q9JJG7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.9 ms