Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc86Q9JJ89 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc86Q9JJ89 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc86Q9JJ89 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc86Q9JJ89 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc86Q9JJ89 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc86Q9JJ89 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc86Q9JJ89 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc86Q9JJ89 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc86Q9JJ89 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc86Q9JJ89 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc86Q9JJ89 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc86Q9JJ89 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc86Q9JJ89 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc86Q9JJ89 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc86Q9JJ89 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc86Q9JJ89 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc86Q9JJ89 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc86Q9JJ89 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc86Q9JJ89 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc86Q9JJ89 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc86Q9JJ89 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc86Q9JJ89 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc86Q9JJ89 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc86Q9JJ89 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc86Q9JJ89 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc86Q9JJ89 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc86Q9JJ89 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc86Q9JJ89 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc86Q9JJ89 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc86Q9JJ89 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc86Q9JJ89 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc86Q9JJ89 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc86Q9JJ89 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc86Q9JJ89 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc86Q9JJ89 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc86Q9JJ89 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc86Q9JJ89 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc86Q9JJ89 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc86Q9JJ89 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc86Q9JJ89 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc86Q9JJ89 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc86Q9JJ89 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc86Q9JJ89 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc86Q9JJ89 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc86Q9JJ89 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc86Q9JJ89 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc86Q9JJ89 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc86Q9JJ89 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc86Q9JJ89 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc86Q9JJ89 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc86Q9JJ89 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc86Q9JJ89 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc86Q9JJ89 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc86Q9JJ89 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc86Q9JJ89 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc86Q9JJ89 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc86Q9JJ89 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc86Q9JJ89 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc86Q9JJ89 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc86Q9JJ89 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc86Q9JJ89 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc86Q9JJ89 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc86Q9JJ89 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc86Q9JJ89 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc86Q9JJ89 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc86Q9JJ89 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc86Q9JJ89 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc86Q9JJ89 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc86Q9JJ89 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc86Q9JJ89 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc86Q9JJ89 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc86Q9JJ89 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc86Q9JJ89 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc86Q9JJ89 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc86Q9JJ89 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc86Q9JJ89 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc86Q9JJ89 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc86Q9JJ89 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc86Q9JJ89 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc86Q9JJ89 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc86Q9JJ89 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc86Q9JJ89 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc86Q9JJ89 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc86Q9JJ89 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc86Q9JJ89 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc86Q9JJ89 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc86Q9JJ89 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc86Q9JJ89 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc86Q9JJ89 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc86Q9JJ89 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc86Q9JJ89 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc86Q9JJ89 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc86Q9JJ89 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc86Q9JJ89 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc86Q9JJ89 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc86Q9JJ89 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc86Q9JJ89 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc86Q9JJ89 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc86Q9JJ89 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 231.7 ms