Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIZ0

Cml1, Probable N-acetyltransferase CML1, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cml1Q9JIZ0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cml1Q9JIZ0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cml1Q9JIZ0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cml1Q9JIZ0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cml1Q9JIZ0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cml1Q9JIZ0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cml1Q9JIZ0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cml1Q9JIZ0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cml1Q9JIZ0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cml1Q9JIZ0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cml1Q9JIZ0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cml1Q9JIZ0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cml1Q9JIZ0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cml1Q9JIZ0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cml1Q9JIZ0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cml1Q9JIZ0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cml1Q9JIZ0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cml1Q9JIZ0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cml1Q9JIZ0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cml1Q9JIZ0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cml1Q9JIZ0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cml1Q9JIZ0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cml1Q9JIZ0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cml1Q9JIZ0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cml1Q9JIZ0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cml1Q9JIZ0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cml1Q9JIZ0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cml1Q9JIZ0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cml1Q9JIZ0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cml1Q9JIZ0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cml1Q9JIZ0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cml1Q9JIZ0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cml1Q9JIZ0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cml1Q9JIZ0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cml1Q9JIZ0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cml1Q9JIZ0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cml1Q9JIZ0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cml1Q9JIZ0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cml1Q9JIZ0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cml1Q9JIZ0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cml1Q9JIZ0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cml1Q9JIZ0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cml1Q9JIZ0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cml1Q9JIZ0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cml1Q9JIZ0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cml1Q9JIZ0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cml1Q9JIZ0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cml1Q9JIZ0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cml1Q9JIZ0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Cml1Q9JIZ0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cml1Q9JIZ0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms