Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lmbr1Q9JIT0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lmbr1Q9JIT0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Lmbr1Q9JIT0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Lmbr1Q9JIT0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lmbr1Q9JIT0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Lmbr1Q9JIT0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lmbr1Q9JIT0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lmbr1Q9JIT0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Lmbr1Q9JIT0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lmbr1Q9JIT0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lmbr1Q9JIT0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lmbr1Q9JIT0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lmbr1Q9JIT0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lmbr1Q9JIT0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lmbr1Q9JIT0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lmbr1Q9JIT0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lmbr1Q9JIT0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lmbr1Q9JIT0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lmbr1Q9JIT0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lmbr1Q9JIT0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lmbr1Q9JIT0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lmbr1Q9JIT0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lmbr1Q9JIT0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lmbr1Q9JIT0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lmbr1Q9JIT0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lmbr1Q9JIT0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lmbr1Q9JIT0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lmbr1Q9JIT0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Lmbr1Q9JIT0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lmbr1Q9JIT0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lmbr1Q9JIT0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lmbr1Q9JIT0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lmbr1Q9JIT0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lmbr1Q9JIT0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lmbr1Q9JIT0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lmbr1Q9JIT0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lmbr1Q9JIT0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lmbr1Q9JIT0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lmbr1Q9JIT0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lmbr1Q9JIT0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lmbr1Q9JIT0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lmbr1Q9JIT0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lmbr1Q9JIT0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lmbr1Q9JIT0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Lmbr1Q9JIT0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lmbr1Q9JIT0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lmbr1Q9JIT0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lmbr1Q9JIT0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lmbr1Q9JIT0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lmbr1Q9JIT0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Lmbr1Q9JIT0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lmbr1Q9JIT0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Lmbr1Q9JIT0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lmbr1Q9JIT0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lmbr1Q9JIT0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lmbr1Q9JIT0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lmbr1Q9JIT0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lmbr1Q9JIT0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lmbr1Q9JIT0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lmbr1Q9JIT0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lmbr1Q9JIT0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lmbr1Q9JIT0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Lmbr1Q9JIT0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lmbr1Q9JIT0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lmbr1Q9JIT0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lmbr1Q9JIT0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lmbr1Q9JIT0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lmbr1Q9JIT0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lmbr1Q9JIT0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lmbr1Q9JIT0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lmbr1Q9JIT0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lmbr1Q9JIT0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lmbr1Q9JIT0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lmbr1Q9JIT0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lmbr1Q9JIT0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lmbr1Q9JIT0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmbr1Q9JIT0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmbr1Q9JIT0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmbr1Q9JIT0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmbr1Q9JIT0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmbr1Q9JIT0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lmbr1Q9JIT0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lmbr1Q9JIT0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lmbr1Q9JIT0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lmbr1Q9JIT0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Lmbr1Q9JIT0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Lmbr1Q9JIT0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Lmbr1Q9JIT0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lmbr1Q9JIT0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmbr1Q9JIT0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmbr1Q9JIT0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmbr1Q9JIT0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmbr1Q9JIT0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmbr1Q9JIT0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmbr1Q9JIT0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmbr1Q9JIT0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmbr1Q9JIT0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmbr1Q9JIT0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms