Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHH9

Copz2, Coatomer subunit zeta-2, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz2Q9JHH9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copz2Q9JHH9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copz2Q9JHH9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copz2Q9JHH9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copz2Q9JHH9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copz2Q9JHH9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copz2Q9JHH9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copz2Q9JHH9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copz2Q9JHH9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Copz2Q9JHH9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copz2Q9JHH9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copz2Q9JHH9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copz2Q9JHH9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copz2Q9JHH9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copz2Q9JHH9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copz2Q9JHH9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copz2Q9JHH9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copz2Q9JHH9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copz2Q9JHH9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copz2Q9JHH9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copz2Q9JHH9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copz2Q9JHH9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Copz2Q9JHH9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Copz2Q9JHH9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Copz2Q9JHH9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Copz2Q9JHH9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Copz2Q9JHH9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Copz2Q9JHH9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Copz2Q9JHH9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Copz2Q9JHH9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Copz2Q9JHH9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Copz2Q9JHH9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Copz2Q9JHH9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Copz2Q9JHH9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Copz2Q9JHH9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copz2Q9JHH9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copz2Q9JHH9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copz2Q9JHH9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copz2Q9JHH9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copz2Q9JHH9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copz2Q9JHH9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copz2Q9JHH9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copz2Q9JHH9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copz2Q9JHH9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copz2Q9JHH9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copz2Q9JHH9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copz2Q9JHH9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copz2Q9JHH9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copz2Q9JHH9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copz2Q9JHH9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copz2Q9JHH9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copz2Q9JHH9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copz2Q9JHH9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Copz2Q9JHH9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Copz2Q9JHH9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Copz2Q9JHH9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Copz2Q9JHH9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Copz2Q9JHH9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Copz2Q9JHH9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Copz2Q9JHH9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Copz2Q9JHH9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Copz2Q9JHH9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Copz2Q9JHH9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Copz2Q9JHH9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Copz2Q9JHH9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Copz2Q9JHH9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Copz2Q9JHH9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Copz2Q9JHH9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Copz2Q9JHH9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Copz2Q9JHH9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Copz2Q9JHH9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Copz2Q9JHH9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Copz2Q9JHH9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Copz2Q9JHH9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Copz2Q9JHH9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Copz2Q9JHH9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Copz2Q9JHH9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Copz2Q9JHH9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Copz2Q9JHH9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Copz2Q9JHH9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copz2Q9JHH9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copz2Q9JHH9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copz2Q9JHH9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copz2Q9JHH9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copz2Q9JHH9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copz2Q9JHH9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copz2Q9JHH9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copz2Q9JHH9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copz2Q9JHH9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Copz2Q9JHH9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Copz2Q9JHH9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Copz2Q9JHH9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Copz2Q9JHH9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Copz2Q9JHH9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Copz2Q9JHH9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Copz2Q9JHH9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Copz2Q9JHH9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Copz2Q9JHH9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Copz2Q9JHH9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Copz2Q9JHH9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms