Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET37

Slc5a4a, Solute carrier family 5 member 4A, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a4aQ9ET37 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc5a4aQ9ET37 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc5a4aQ9ET37 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc5a4aQ9ET37 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc5a4aQ9ET37 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc5a4aQ9ET37 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc5a4aQ9ET37 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc5a4aQ9ET37 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc5a4aQ9ET37 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc5a4aQ9ET37 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc5a4aQ9ET37 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc5a4aQ9ET37 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc5a4aQ9ET37 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc5a4aQ9ET37 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc5a4aQ9ET37 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc5a4aQ9ET37 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc5a4aQ9ET37 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc5a4aQ9ET37 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc5a4aQ9ET37 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc5a4aQ9ET37 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc5a4aQ9ET37 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc5a4aQ9ET37 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc5a4aQ9ET37 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc5a4aQ9ET37 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc5a4aQ9ET37 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc5a4aQ9ET37 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc5a4aQ9ET37 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc5a4aQ9ET37 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc5a4aQ9ET37 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc5a4aQ9ET37 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc5a4aQ9ET37 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc5a4aQ9ET37 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc5a4aQ9ET37 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc5a4aQ9ET37 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc5a4aQ9ET37 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc5a4aQ9ET37 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc5a4aQ9ET37 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc5a4aQ9ET37 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc5a4aQ9ET37 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc5a4aQ9ET37 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc5a4aQ9ET37 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc5a4aQ9ET37 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc5a4aQ9ET37 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc5a4aQ9ET37 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc5a4aQ9ET37 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc5a4aQ9ET37 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc5a4aQ9ET37 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc5a4aQ9ET37 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc5a4aQ9ET37 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc5a4aQ9ET37 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc5a4aQ9ET37 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc5a4aQ9ET37 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc5a4aQ9ET37 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc5a4aQ9ET37 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc5a4aQ9ET37 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Slc5a4aQ9ET37 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc5a4aQ9ET37 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc5a4aQ9ET37 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc5a4aQ9ET37 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc5a4aQ9ET37 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc5a4aQ9ET37 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc5a4aQ9ET37 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc5a4aQ9ET37 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc5a4aQ9ET37 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc5a4aQ9ET37 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc5a4aQ9ET37 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc5a4aQ9ET37 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc5a4aQ9ET37 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc5a4aQ9ET37 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc5a4aQ9ET37 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc5a4aQ9ET37 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc5a4aQ9ET37 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc5a4aQ9ET37 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc5a4aQ9ET37 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc5a4aQ9ET37 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc5a4aQ9ET37 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc5a4aQ9ET37 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc5a4aQ9ET37 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc5a4aQ9ET37 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc5a4aQ9ET37 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc5a4aQ9ET37 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc5a4aQ9ET37 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc5a4aQ9ET37 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc5a4aQ9ET37 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc5a4aQ9ET37 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc5a4aQ9ET37 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc5a4aQ9ET37 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc5a4aQ9ET37 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc5a4aQ9ET37 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc5a4aQ9ET37 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc5a4aQ9ET37 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc5a4aQ9ET37 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc5a4aQ9ET37 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc5a4aQ9ET37 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc5a4aQ9ET37 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc5a4aQ9ET37 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc5a4aQ9ET37 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc5a4aQ9ET37 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc5a4aQ9ET37 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc5a4aQ9ET37 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms