Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESU6

Brd4, Bromodomain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd4Q9ESU6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Brd4Q9ESU6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Brd4Q9ESU6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Brd4Q9ESU6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Brd4Q9ESU6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
Brd4Q9ESU6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Brd4Q9ESU6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Brd4Q9ESU6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Brd4Q9ESU6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Brd4Q9ESU6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Brd4Q9ESU6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Brd4Q9ESU6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Brd4Q9ESU6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Brd4Q9ESU6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Brd4Q9ESU6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Brd4Q9ESU6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
Brd4Q9ESU6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Brd4Q9ESU6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Brd4Q9ESU6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Brd4Q9ESU6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Brd4Q9ESU6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Brd4Q9ESU6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Brd4Q9ESU6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Brd4Q9ESU6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Brd4Q9ESU6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Brd4Q9ESU6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Brd4Q9ESU6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Brd4Q9ESU6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Brd4Q9ESU6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Brd4Q9ESU6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Brd4Q9ESU6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
Brd4Q9ESU6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
Brd4Q9ESU6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Brd4Q9ESU6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Brd4Q9ESU6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Brd4Q9ESU6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Brd4Q9ESU6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
Brd4Q9ESU6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
Brd4Q9ESU6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Brd4Q9ESU6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Brd4Q9ESU6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Brd4Q9ESU6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Brd4Q9ESU6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
Brd4Q9ESU6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Brd4Q9ESU6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
Brd4Q9ESU6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Brd4Q9ESU6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Brd4Q9ESU6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Brd4Q9ESU6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Brd4Q9ESU6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Brd4Q9ESU6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Brd4Q9ESU6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Brd4Q9ESU6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Brd4Q9ESU6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Brd4Q9ESU6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Brd4Q9ESU6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Brd4Q9ESU6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
Brd4Q9ESU6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Brd4Q9ESU6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Brd4Q9ESU6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Brd4Q9ESU6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Brd4Q9ESU6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Brd4Q9ESU6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Brd4Q9ESU6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Brd4Q9ESU6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Brd4Q9ESU6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Brd4Q9ESU6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Brd4Q9ESU6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Brd4Q9ESU6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Brd4Q9ESU6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Brd4Q9ESU6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
Brd4Q9ESU6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Brd4Q9ESU6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
Brd4Q9ESU6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Brd4Q9ESU6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Brd4Q9ESU6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Brd4Q9ESU6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Brd4Q9ESU6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Brd4Q9ESU6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Brd4Q9ESU6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Brd4Q9ESU6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
Brd4Q9ESU6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Brd4Q9ESU6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Brd4Q9ESU6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Brd4Q9ESU6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Brd4Q9ESU6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
Brd4Q9ESU6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Brd4Q9ESU6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Brd4Q9ESU6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Brd4Q9ESU6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Brd4Q9ESU6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Brd4Q9ESU6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Brd4Q9ESU6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Brd4Q9ESU6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Brd4Q9ESU6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Brd4Q9ESU6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Brd4Q9ESU6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Brd4Q9ESU6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Brd4Q9ESU6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Brd4Q9ESU6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms