Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG4

Tmem27, Collectrin, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem27Q9ESG4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem27Q9ESG4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem27Q9ESG4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem27Q9ESG4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem27Q9ESG4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem27Q9ESG4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem27Q9ESG4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem27Q9ESG4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem27Q9ESG4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem27Q9ESG4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem27Q9ESG4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem27Q9ESG4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem27Q9ESG4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem27Q9ESG4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem27Q9ESG4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem27Q9ESG4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem27Q9ESG4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem27Q9ESG4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem27Q9ESG4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem27Q9ESG4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem27Q9ESG4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem27Q9ESG4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem27Q9ESG4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem27Q9ESG4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem27Q9ESG4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem27Q9ESG4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem27Q9ESG4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem27Q9ESG4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem27Q9ESG4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem27Q9ESG4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem27Q9ESG4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem27Q9ESG4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem27Q9ESG4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem27Q9ESG4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem27Q9ESG4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem27Q9ESG4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem27Q9ESG4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem27Q9ESG4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem27Q9ESG4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem27Q9ESG4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem27Q9ESG4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem27Q9ESG4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem27Q9ESG4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem27Q9ESG4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem27Q9ESG4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem27Q9ESG4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem27Q9ESG4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem27Q9ESG4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem27Q9ESG4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem27Q9ESG4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem27Q9ESG4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem27Q9ESG4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem27Q9ESG4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem27Q9ESG4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem27Q9ESG4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem27Q9ESG4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem27Q9ESG4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem27Q9ESG4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem27Q9ESG4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem27Q9ESG4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem27Q9ESG4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem27Q9ESG4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem27Q9ESG4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem27Q9ESG4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem27Q9ESG4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem27Q9ESG4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem27Q9ESG4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem27Q9ESG4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem27Q9ESG4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem27Q9ESG4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem27Q9ESG4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem27Q9ESG4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem27Q9ESG4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem27Q9ESG4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem27Q9ESG4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem27Q9ESG4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem27Q9ESG4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem27Q9ESG4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem27Q9ESG4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem27Q9ESG4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem27Q9ESG4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmem27Q9ESG4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem27Q9ESG4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem27Q9ESG4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem27Q9ESG4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem27Q9ESG4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem27Q9ESG4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem27Q9ESG4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem27Q9ESG4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem27Q9ESG4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem27Q9ESG4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem27Q9ESG4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem27Q9ESG4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem27Q9ESG4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem27Q9ESG4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem27Q9ESG4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem27Q9ESG4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem27Q9ESG4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem27Q9ESG4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem27Q9ESG4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms