Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK4

Cse1l, Exportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cse1lQ9ERK4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cse1lQ9ERK4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cse1lQ9ERK4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cse1lQ9ERK4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cse1lQ9ERK4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cse1lQ9ERK4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cse1lQ9ERK4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cse1lQ9ERK4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cse1lQ9ERK4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cse1lQ9ERK4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cse1lQ9ERK4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cse1lQ9ERK4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cse1lQ9ERK4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cse1lQ9ERK4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cse1lQ9ERK4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cse1lQ9ERK4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cse1lQ9ERK4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cse1lQ9ERK4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cse1lQ9ERK4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cse1lQ9ERK4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cse1lQ9ERK4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cse1lQ9ERK4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cse1lQ9ERK4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cse1lQ9ERK4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cse1lQ9ERK4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cse1lQ9ERK4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cse1lQ9ERK4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cse1lQ9ERK4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cse1lQ9ERK4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cse1lQ9ERK4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cse1lQ9ERK4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cse1lQ9ERK4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cse1lQ9ERK4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cse1lQ9ERK4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cse1lQ9ERK4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cse1lQ9ERK4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cse1lQ9ERK4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cse1lQ9ERK4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cse1lQ9ERK4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cse1lQ9ERK4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cse1lQ9ERK4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cse1lQ9ERK4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cse1lQ9ERK4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cse1lQ9ERK4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cse1lQ9ERK4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cse1lQ9ERK4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cse1lQ9ERK4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cse1lQ9ERK4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cse1lQ9ERK4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cse1lQ9ERK4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cse1lQ9ERK4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cse1lQ9ERK4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cse1lQ9ERK4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cse1lQ9ERK4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cse1lQ9ERK4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cse1lQ9ERK4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cse1lQ9ERK4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cse1lQ9ERK4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cse1lQ9ERK4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cse1lQ9ERK4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cse1lQ9ERK4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cse1lQ9ERK4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cse1lQ9ERK4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cse1lQ9ERK4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cse1lQ9ERK4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cse1lQ9ERK4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cse1lQ9ERK4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cse1lQ9ERK4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cse1lQ9ERK4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cse1lQ9ERK4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cse1lQ9ERK4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cse1lQ9ERK4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cse1lQ9ERK4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cse1lQ9ERK4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cse1lQ9ERK4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cse1lQ9ERK4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cse1lQ9ERK4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cse1lQ9ERK4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cse1lQ9ERK4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cse1lQ9ERK4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cse1lQ9ERK4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cse1lQ9ERK4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cse1lQ9ERK4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cse1lQ9ERK4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cse1lQ9ERK4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cse1lQ9ERK4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cse1lQ9ERK4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cse1lQ9ERK4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cse1lQ9ERK4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cse1lQ9ERK4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cse1lQ9ERK4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cse1lQ9ERK4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cse1lQ9ERK4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cse1lQ9ERK4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cse1lQ9ERK4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cse1lQ9ERK4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cse1lQ9ERK4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cse1lQ9ERK4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cse1lQ9ERK4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cse1lQ9ERK4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms