Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc28a3Q9ERH8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc28a3Q9ERH8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc28a3Q9ERH8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc28a3Q9ERH8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc28a3Q9ERH8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc28a3Q9ERH8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc28a3Q9ERH8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc28a3Q9ERH8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc28a3Q9ERH8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc28a3Q9ERH8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc28a3Q9ERH8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc28a3Q9ERH8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc28a3Q9ERH8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc28a3Q9ERH8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc28a3Q9ERH8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc28a3Q9ERH8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc28a3Q9ERH8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc28a3Q9ERH8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc28a3Q9ERH8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc28a3Q9ERH8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc28a3Q9ERH8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc28a3Q9ERH8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc28a3Q9ERH8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc28a3Q9ERH8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc28a3Q9ERH8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc28a3Q9ERH8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc28a3Q9ERH8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc28a3Q9ERH8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc28a3Q9ERH8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc28a3Q9ERH8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc28a3Q9ERH8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc28a3Q9ERH8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc28a3Q9ERH8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc28a3Q9ERH8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc28a3Q9ERH8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc28a3Q9ERH8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc28a3Q9ERH8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc28a3Q9ERH8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc28a3Q9ERH8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc28a3Q9ERH8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc28a3Q9ERH8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc28a3Q9ERH8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc28a3Q9ERH8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc28a3Q9ERH8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc28a3Q9ERH8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc28a3Q9ERH8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc28a3Q9ERH8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc28a3Q9ERH8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc28a3Q9ERH8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc28a3Q9ERH8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc28a3Q9ERH8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc28a3Q9ERH8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc28a3Q9ERH8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc28a3Q9ERH8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc28a3Q9ERH8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc28a3Q9ERH8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc28a3Q9ERH8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc28a3Q9ERH8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc28a3Q9ERH8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc28a3Q9ERH8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc28a3Q9ERH8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc28a3Q9ERH8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc28a3Q9ERH8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc28a3Q9ERH8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc28a3Q9ERH8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc28a3Q9ERH8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc28a3Q9ERH8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc28a3Q9ERH8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc28a3Q9ERH8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc28a3Q9ERH8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc28a3Q9ERH8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc28a3Q9ERH8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc28a3Q9ERH8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc28a3Q9ERH8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc28a3Q9ERH8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc28a3Q9ERH8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc28a3Q9ERH8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc28a3Q9ERH8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc28a3Q9ERH8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc28a3Q9ERH8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc28a3Q9ERH8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc28a3Q9ERH8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc28a3Q9ERH8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc28a3Q9ERH8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc28a3Q9ERH8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc28a3Q9ERH8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc28a3Q9ERH8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc28a3Q9ERH8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc28a3Q9ERH8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc28a3Q9ERH8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc28a3Q9ERH8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc28a3Q9ERH8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc28a3Q9ERH8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc28a3Q9ERH8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc28a3Q9ERH8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc28a3Q9ERH8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc28a3Q9ERH8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc28a3Q9ERH8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc28a3Q9ERH8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms