Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dap3Q9ER88 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Dap3Q9ER88 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Dap3Q9ER88 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dap3Q9ER88 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dap3Q9ER88 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dap3Q9ER88 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dap3Q9ER88 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dap3Q9ER88 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dap3Q9ER88 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dap3Q9ER88 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dap3Q9ER88 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dap3Q9ER88 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dap3Q9ER88 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dap3Q9ER88 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dap3Q9ER88 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dap3Q9ER88 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dap3Q9ER88 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dap3Q9ER88 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dap3Q9ER88 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dap3Q9ER88 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dap3Q9ER88 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dap3Q9ER88 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dap3Q9ER88 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dap3Q9ER88 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dap3Q9ER88 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dap3Q9ER88 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dap3Q9ER88 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dap3Q9ER88 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dap3Q9ER88 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dap3Q9ER88 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dap3Q9ER88 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dap3Q9ER88 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dap3Q9ER88 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dap3Q9ER88 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dap3Q9ER88 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dap3Q9ER88 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dap3Q9ER88 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dap3Q9ER88 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dap3Q9ER88 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dap3Q9ER88 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dap3Q9ER88 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dap3Q9ER88 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dap3Q9ER88 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dap3Q9ER88 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Dap3Q9ER88 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dap3Q9ER88 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dap3Q9ER88 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dap3Q9ER88 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dap3Q9ER88 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dap3Q9ER88 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dap3Q9ER88 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dap3Q9ER88 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Dap3Q9ER88 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dap3Q9ER88 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Dap3Q9ER88 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dap3Q9ER88 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dap3Q9ER88 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Dap3Q9ER88 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Dap3Q9ER88 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Dap3Q9ER88 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Dap3Q9ER88 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Dap3Q9ER88 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Dap3Q9ER88 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Dap3Q9ER88 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Dap3Q9ER88 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Dap3Q9ER88 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Dap3Q9ER88 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Dap3Q9ER88 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Dap3Q9ER88 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dap3Q9ER88 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dap3Q9ER88 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dap3Q9ER88 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dap3Q9ER88 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dap3Q9ER88 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dap3Q9ER88 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dap3Q9ER88 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dap3Q9ER88 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dap3Q9ER88 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dap3Q9ER88 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dap3Q9ER88 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dap3Q9ER88 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dap3Q9ER88 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dap3Q9ER88 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dap3Q9ER88 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dap3Q9ER88 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dap3Q9ER88 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dap3Q9ER88 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dap3Q9ER88 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dap3Q9ER88 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dap3Q9ER88 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dap3Q9ER88 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dap3Q9ER88 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dap3Q9ER88 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dap3Q9ER88 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dap3Q9ER88 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dap3Q9ER88 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dap3Q9ER88 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dap3Q9ER88 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dap3Q9ER88 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms