Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxcr6Q9EQ16 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxcr6Q9EQ16 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxcr6Q9EQ16 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxcr6Q9EQ16 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxcr6Q9EQ16 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxcr6Q9EQ16 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcr6Q9EQ16 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcr6Q9EQ16 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcr6Q9EQ16 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcr6Q9EQ16 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcr6Q9EQ16 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcr6Q9EQ16 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcr6Q9EQ16 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcr6Q9EQ16 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcr6Q9EQ16 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcr6Q9EQ16 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcr6Q9EQ16 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcr6Q9EQ16 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcr6Q9EQ16 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcr6Q9EQ16 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcr6Q9EQ16 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcr6Q9EQ16 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcr6Q9EQ16 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcr6Q9EQ16 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcr6Q9EQ16 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Cxcr6Q9EQ16 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcr6Q9EQ16 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcr6Q9EQ16 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcr6Q9EQ16 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcr6Q9EQ16 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcr6Q9EQ16 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcr6Q9EQ16 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcr6Q9EQ16 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcr6Q9EQ16 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcr6Q9EQ16 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcr6Q9EQ16 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcr6Q9EQ16 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcr6Q9EQ16 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcr6Q9EQ16 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcr6Q9EQ16 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcr6Q9EQ16 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcr6Q9EQ16 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcr6Q9EQ16 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcr6Q9EQ16 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcr6Q9EQ16 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcr6Q9EQ16 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcr6Q9EQ16 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcr6Q9EQ16 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcr6Q9EQ16 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcr6Q9EQ16 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcr6Q9EQ16 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcr6Q9EQ16 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcr6Q9EQ16 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcr6Q9EQ16 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcr6Q9EQ16 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcr6Q9EQ16 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcr6Q9EQ16 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcr6Q9EQ16 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcr6Q9EQ16 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcr6Q9EQ16 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcr6Q9EQ16 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcr6Q9EQ16 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcr6Q9EQ16 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcr6Q9EQ16 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcr6Q9EQ16 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxcr6Q9EQ16 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxcr6Q9EQ16 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxcr6Q9EQ16 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxcr6Q9EQ16 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxcr6Q9EQ16 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxcr6Q9EQ16 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxcr6Q9EQ16 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxcr6Q9EQ16 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxcr6Q9EQ16 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxcr6Q9EQ16 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxcr6Q9EQ16 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxcr6Q9EQ16 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxcr6Q9EQ16 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxcr6Q9EQ16 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxcr6Q9EQ16 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxcr6Q9EQ16 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxcr6Q9EQ16 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxcr6Q9EQ16 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxcr6Q9EQ16 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxcr6Q9EQ16 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxcr6Q9EQ16 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxcr6Q9EQ16 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxcr6Q9EQ16 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxcr6Q9EQ16 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxcr6Q9EQ16 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxcr6Q9EQ16 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxcr6Q9EQ16 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cxcr6Q9EQ16 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cxcr6Q9EQ16 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cxcr6Q9EQ16 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cxcr6Q9EQ16 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cxcr6Q9EQ16 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cxcr6Q9EQ16 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cxcr6Q9EQ16 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms