Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL6

Mmp1b, Interstitial collagenase B, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp1bQ9EPL6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mmp1bQ9EPL6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mmp1bQ9EPL6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mmp1bQ9EPL6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mmp1bQ9EPL6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mmp1bQ9EPL6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mmp1bQ9EPL6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mmp1bQ9EPL6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mmp1bQ9EPL6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mmp1bQ9EPL6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mmp1bQ9EPL6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mmp1bQ9EPL6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mmp1bQ9EPL6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mmp1bQ9EPL6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mmp1bQ9EPL6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mmp1bQ9EPL6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mmp1bQ9EPL6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mmp1bQ9EPL6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mmp1bQ9EPL6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mmp1bQ9EPL6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mmp1bQ9EPL6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mmp1bQ9EPL6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Mmp1bQ9EPL6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mmp1bQ9EPL6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mmp1bQ9EPL6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mmp1bQ9EPL6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mmp1bQ9EPL6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mmp1bQ9EPL6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mmp1bQ9EPL6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mmp1bQ9EPL6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mmp1bQ9EPL6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mmp1bQ9EPL6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mmp1bQ9EPL6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mmp1bQ9EPL6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mmp1bQ9EPL6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mmp1bQ9EPL6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mmp1bQ9EPL6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mmp1bQ9EPL6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mmp1bQ9EPL6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mmp1bQ9EPL6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mmp1bQ9EPL6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mmp1bQ9EPL6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mmp1bQ9EPL6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mmp1bQ9EPL6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mmp1bQ9EPL6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mmp1bQ9EPL6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mmp1bQ9EPL6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Mmp1bQ9EPL6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mmp1bQ9EPL6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mmp1bQ9EPL6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mmp1bQ9EPL6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mmp1bQ9EPL6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mmp1bQ9EPL6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mmp1bQ9EPL6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mmp1bQ9EPL6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mmp1bQ9EPL6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mmp1bQ9EPL6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mmp1bQ9EPL6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mmp1bQ9EPL6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Mmp1bQ9EPL6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mmp1bQ9EPL6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mmp1bQ9EPL6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Mmp1bQ9EPL6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mmp1bQ9EPL6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mmp1bQ9EPL6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mmp1bQ9EPL6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mmp1bQ9EPL6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mmp1bQ9EPL6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mmp1bQ9EPL6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mmp1bQ9EPL6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mmp1bQ9EPL6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mmp1bQ9EPL6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mmp1bQ9EPL6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mmp1bQ9EPL6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mmp1bQ9EPL6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mmp1bQ9EPL6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Mmp1bQ9EPL6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mmp1bQ9EPL6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mmp1bQ9EPL6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mmp1bQ9EPL6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mmp1bQ9EPL6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mmp1bQ9EPL6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mmp1bQ9EPL6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mmp1bQ9EPL6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mmp1bQ9EPL6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mmp1bQ9EPL6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mmp1bQ9EPL6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mmp1bQ9EPL6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mmp1bQ9EPL6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mmp1bQ9EPL6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mmp1bQ9EPL6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mmp1bQ9EPL6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mmp1bQ9EPL6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mmp1bQ9EPL6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Mmp1bQ9EPL6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mmp1bQ9EPL6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mmp1bQ9EPL6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mmp1bQ9EPL6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mmp1bQ9EPL6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mmp1bQ9EPL6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 272.4 ms