Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK2

Rp2, Protein XRP2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp2Q9EPK2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rp2Q9EPK2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rp2Q9EPK2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rp2Q9EPK2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rp2Q9EPK2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rp2Q9EPK2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rp2Q9EPK2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rp2Q9EPK2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rp2Q9EPK2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rp2Q9EPK2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rp2Q9EPK2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rp2Q9EPK2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rp2Q9EPK2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rp2Q9EPK2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rp2Q9EPK2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rp2Q9EPK2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rp2Q9EPK2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rp2Q9EPK2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rp2Q9EPK2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rp2Q9EPK2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rp2Q9EPK2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rp2Q9EPK2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rp2Q9EPK2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rp2Q9EPK2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rp2Q9EPK2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rp2Q9EPK2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rp2Q9EPK2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rp2Q9EPK2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rp2Q9EPK2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rp2Q9EPK2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rp2Q9EPK2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rp2Q9EPK2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rp2Q9EPK2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rp2Q9EPK2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rp2Q9EPK2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rp2Q9EPK2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rp2Q9EPK2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rp2Q9EPK2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rp2Q9EPK2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rp2Q9EPK2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rp2Q9EPK2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rp2Q9EPK2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rp2Q9EPK2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rp2Q9EPK2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rp2Q9EPK2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rp2Q9EPK2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rp2Q9EPK2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rp2Q9EPK2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rp2Q9EPK2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rp2Q9EPK2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rp2Q9EPK2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rp2Q9EPK2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rp2Q9EPK2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rp2Q9EPK2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rp2Q9EPK2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rp2Q9EPK2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rp2Q9EPK2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rp2Q9EPK2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rp2Q9EPK2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rp2Q9EPK2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rp2Q9EPK2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rp2Q9EPK2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rp2Q9EPK2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rp2Q9EPK2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rp2Q9EPK2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rp2Q9EPK2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rp2Q9EPK2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rp2Q9EPK2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rp2Q9EPK2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rp2Q9EPK2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rp2Q9EPK2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rp2Q9EPK2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rp2Q9EPK2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rp2Q9EPK2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rp2Q9EPK2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rp2Q9EPK2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rp2Q9EPK2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rp2Q9EPK2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rp2Q9EPK2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rp2Q9EPK2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rp2Q9EPK2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rp2Q9EPK2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rp2Q9EPK2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rp2Q9EPK2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rp2Q9EPK2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rp2Q9EPK2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rp2Q9EPK2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rp2Q9EPK2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rp2Q9EPK2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rp2Q9EPK2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rp2Q9EPK2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rp2Q9EPK2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rp2Q9EPK2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rp2Q9EPK2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rp2Q9EPK2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rp2Q9EPK2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rp2Q9EPK2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rp2Q9EPK2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rp2Q9EPK2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rp2Q9EPK2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms