Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Riok3Q9DBU3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Riok3Q9DBU3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Riok3Q9DBU3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Riok3Q9DBU3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Riok3Q9DBU3 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Riok3Q9DBU3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Riok3Q9DBU3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Riok3Q9DBU3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Riok3Q9DBU3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Riok3Q9DBU3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Riok3Q9DBU3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Riok3Q9DBU3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Riok3Q9DBU3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Riok3Q9DBU3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Riok3Q9DBU3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Riok3Q9DBU3 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Riok3Q9DBU3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Riok3Q9DBU3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Riok3Q9DBU3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Riok3Q9DBU3 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Riok3Q9DBU3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Riok3Q9DBU3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Riok3Q9DBU3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Riok3Q9DBU3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Riok3Q9DBU3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Riok3Q9DBU3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Riok3Q9DBU3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Riok3Q9DBU3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Riok3Q9DBU3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Riok3Q9DBU3 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Riok3Q9DBU3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Riok3Q9DBU3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Riok3Q9DBU3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Riok3Q9DBU3 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Riok3Q9DBU3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Riok3Q9DBU3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Riok3Q9DBU3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Riok3Q9DBU3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Riok3Q9DBU3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Riok3Q9DBU3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Riok3Q9DBU3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Riok3Q9DBU3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Riok3Q9DBU3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Riok3Q9DBU3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Riok3Q9DBU3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Riok3Q9DBU3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Riok3Q9DBU3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Riok3Q9DBU3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Riok3Q9DBU3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Riok3Q9DBU3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Riok3Q9DBU3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Riok3Q9DBU3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Riok3Q9DBU3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Riok3Q9DBU3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Riok3Q9DBU3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Riok3Q9DBU3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Riok3Q9DBU3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Riok3Q9DBU3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Riok3Q9DBU3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Riok3Q9DBU3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Riok3Q9DBU3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Riok3Q9DBU3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Riok3Q9DBU3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Riok3Q9DBU3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Riok3Q9DBU3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Riok3Q9DBU3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Riok3Q9DBU3 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Riok3Q9DBU3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Riok3Q9DBU3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Riok3Q9DBU3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Riok3Q9DBU3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Riok3Q9DBU3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Riok3Q9DBU3 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Riok3Q9DBU3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Riok3Q9DBU3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Riok3Q9DBU3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Riok3Q9DBU3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Riok3Q9DBU3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Riok3Q9DBU3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Riok3Q9DBU3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Riok3Q9DBU3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Riok3Q9DBU3 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Riok3Q9DBU3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Riok3Q9DBU3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Riok3Q9DBU3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Riok3Q9DBU3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Riok3Q9DBU3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Riok3Q9DBU3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Riok3Q9DBU3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Riok3Q9DBU3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Riok3Q9DBU3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Riok3Q9DBU3 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Riok3Q9DBU3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Riok3Q9DBU3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Riok3Q9DBU3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Riok3Q9DBU3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Riok3Q9DBU3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Riok3Q9DBU3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Riok3Q9DBU3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms