Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBR1

Xrn2, 5'-3' exoribonuclease 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrn2Q9DBR1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Xrn2Q9DBR1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Xrn2Q9DBR1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Xrn2Q9DBR1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Xrn2Q9DBR1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Xrn2Q9DBR1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Xrn2Q9DBR1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Xrn2Q9DBR1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Xrn2Q9DBR1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Xrn2Q9DBR1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Xrn2Q9DBR1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Xrn2Q9DBR1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Xrn2Q9DBR1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Xrn2Q9DBR1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Xrn2Q9DBR1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Xrn2Q9DBR1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Xrn2Q9DBR1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Xrn2Q9DBR1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Xrn2Q9DBR1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Xrn2Q9DBR1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Xrn2Q9DBR1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Xrn2Q9DBR1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Xrn2Q9DBR1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Xrn2Q9DBR1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Xrn2Q9DBR1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Xrn2Q9DBR1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Xrn2Q9DBR1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Xrn2Q9DBR1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Xrn2Q9DBR1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Xrn2Q9DBR1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Xrn2Q9DBR1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Xrn2Q9DBR1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Xrn2Q9DBR1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Xrn2Q9DBR1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Xrn2Q9DBR1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Xrn2Q9DBR1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Xrn2Q9DBR1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Xrn2Q9DBR1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Xrn2Q9DBR1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Xrn2Q9DBR1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Xrn2Q9DBR1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Xrn2Q9DBR1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Xrn2Q9DBR1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Xrn2Q9DBR1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Xrn2Q9DBR1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Xrn2Q9DBR1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Xrn2Q9DBR1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Xrn2Q9DBR1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Xrn2Q9DBR1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Xrn2Q9DBR1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Xrn2Q9DBR1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Xrn2Q9DBR1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Xrn2Q9DBR1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Xrn2Q9DBR1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Xrn2Q9DBR1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Xrn2Q9DBR1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xrn2Q9DBR1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xrn2Q9DBR1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xrn2Q9DBR1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Xrn2Q9DBR1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xrn2Q9DBR1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xrn2Q9DBR1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xrn2Q9DBR1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xrn2Q9DBR1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xrn2Q9DBR1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Xrn2Q9DBR1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Xrn2Q9DBR1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Xrn2Q9DBR1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Xrn2Q9DBR1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Xrn2Q9DBR1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Xrn2Q9DBR1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Xrn2Q9DBR1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Xrn2Q9DBR1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Xrn2Q9DBR1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Xrn2Q9DBR1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Xrn2Q9DBR1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Xrn2Q9DBR1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Xrn2Q9DBR1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Xrn2Q9DBR1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Xrn2Q9DBR1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Xrn2Q9DBR1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Xrn2Q9DBR1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Xrn2Q9DBR1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Xrn2Q9DBR1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Xrn2Q9DBR1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Xrn2Q9DBR1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Xrn2Q9DBR1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Xrn2Q9DBR1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Xrn2Q9DBR1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Xrn2Q9DBR1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Xrn2Q9DBR1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Xrn2Q9DBR1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Xrn2Q9DBR1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Xrn2Q9DBR1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Xrn2Q9DBR1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Xrn2Q9DBR1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Xrn2Q9DBR1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Xrn2Q9DBR1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Xrn2Q9DBR1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Xrn2Q9DBR1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms