Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9F7

Speer4b, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4bQ9D9F7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Speer4bQ9D9F7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Speer4bQ9D9F7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Speer4bQ9D9F7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Speer4bQ9D9F7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Speer4bQ9D9F7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Speer4bQ9D9F7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Speer4bQ9D9F7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Speer4bQ9D9F7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Speer4bQ9D9F7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Speer4bQ9D9F7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Speer4bQ9D9F7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Speer4bQ9D9F7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Speer4bQ9D9F7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Speer4bQ9D9F7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Speer4bQ9D9F7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Speer4bQ9D9F7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Speer4bQ9D9F7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Speer4bQ9D9F7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Speer4bQ9D9F7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Speer4bQ9D9F7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Speer4bQ9D9F7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Speer4bQ9D9F7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Speer4bQ9D9F7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Speer4bQ9D9F7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Speer4bQ9D9F7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Speer4bQ9D9F7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Speer4bQ9D9F7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Speer4bQ9D9F7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Speer4bQ9D9F7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Speer4bQ9D9F7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Speer4bQ9D9F7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Speer4bQ9D9F7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Speer4bQ9D9F7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Speer4bQ9D9F7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Speer4bQ9D9F7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Speer4bQ9D9F7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Speer4bQ9D9F7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Speer4bQ9D9F7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Speer4bQ9D9F7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Speer4bQ9D9F7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Speer4bQ9D9F7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Speer4bQ9D9F7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Speer4bQ9D9F7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Speer4bQ9D9F7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Speer4bQ9D9F7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Speer4bQ9D9F7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Speer4bQ9D9F7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Speer4bQ9D9F7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Speer4bQ9D9F7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Speer4bQ9D9F7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Speer4bQ9D9F7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Speer4bQ9D9F7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Speer4bQ9D9F7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Speer4bQ9D9F7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Speer4bQ9D9F7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Speer4bQ9D9F7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Speer4bQ9D9F7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Speer4bQ9D9F7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Speer4bQ9D9F7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Speer4bQ9D9F7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Speer4bQ9D9F7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Speer4bQ9D9F7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Speer4bQ9D9F7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Speer4bQ9D9F7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Speer4bQ9D9F7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Speer4bQ9D9F7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Speer4bQ9D9F7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Speer4bQ9D9F7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Speer4bQ9D9F7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Speer4bQ9D9F7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Speer4bQ9D9F7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Speer4bQ9D9F7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Speer4bQ9D9F7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Speer4bQ9D9F7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Speer4bQ9D9F7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Speer4bQ9D9F7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Speer4bQ9D9F7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Speer4bQ9D9F7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Speer4bQ9D9F7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Speer4bQ9D9F7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Speer4bQ9D9F7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Speer4bQ9D9F7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Speer4bQ9D9F7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Speer4bQ9D9F7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Speer4bQ9D9F7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Speer4bQ9D9F7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Speer4bQ9D9F7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Speer4bQ9D9F7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Speer4bQ9D9F7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Speer4bQ9D9F7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Speer4bQ9D9F7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Speer4bQ9D9F7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Speer4bQ9D9F7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Speer4bQ9D9F7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Speer4bQ9D9F7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Speer4bQ9D9F7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Speer4bQ9D9F7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Speer4bQ9D9F7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Speer4bQ9D9F7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms