Protein–RNA interactions for Protein: Q9D968

Hcfc2, Host cell factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcfc2Q9D968 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hcfc2Q9D968 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hcfc2Q9D968 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hcfc2Q9D968 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hcfc2Q9D968 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hcfc2Q9D968 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hcfc2Q9D968 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hcfc2Q9D968 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hcfc2Q9D968 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hcfc2Q9D968 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hcfc2Q9D968 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hcfc2Q9D968 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hcfc2Q9D968 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hcfc2Q9D968 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hcfc2Q9D968 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hcfc2Q9D968 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hcfc2Q9D968 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hcfc2Q9D968 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hcfc2Q9D968 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hcfc2Q9D968 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hcfc2Q9D968 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hcfc2Q9D968 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hcfc2Q9D968 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcfc2Q9D968 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcfc2Q9D968 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcfc2Q9D968 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcfc2Q9D968 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcfc2Q9D968 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcfc2Q9D968 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcfc2Q9D968 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcfc2Q9D968 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcfc2Q9D968 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcfc2Q9D968 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcfc2Q9D968 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcfc2Q9D968 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcfc2Q9D968 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcfc2Q9D968 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcfc2Q9D968 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcfc2Q9D968 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcfc2Q9D968 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcfc2Q9D968 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcfc2Q9D968 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcfc2Q9D968 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcfc2Q9D968 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcfc2Q9D968 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcfc2Q9D968 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcfc2Q9D968 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcfc2Q9D968 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcfc2Q9D968 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcfc2Q9D968 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcfc2Q9D968 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcfc2Q9D968 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcfc2Q9D968 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcfc2Q9D968 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcfc2Q9D968 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcfc2Q9D968 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcfc2Q9D968 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcfc2Q9D968 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hcfc2Q9D968 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcfc2Q9D968 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcfc2Q9D968 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcfc2Q9D968 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcfc2Q9D968 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcfc2Q9D968 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcfc2Q9D968 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcfc2Q9D968 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcfc2Q9D968 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcfc2Q9D968 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcfc2Q9D968 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcfc2Q9D968 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcfc2Q9D968 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcfc2Q9D968 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcfc2Q9D968 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcfc2Q9D968 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcfc2Q9D968 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcfc2Q9D968 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcfc2Q9D968 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcfc2Q9D968 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcfc2Q9D968 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcfc2Q9D968 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcfc2Q9D968 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcfc2Q9D968 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcfc2Q9D968 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcfc2Q9D968 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcfc2Q9D968 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcfc2Q9D968 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcfc2Q9D968 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcfc2Q9D968 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcfc2Q9D968 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcfc2Q9D968 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcfc2Q9D968 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcfc2Q9D968 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcfc2Q9D968 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcfc2Q9D968 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcfc2Q9D968 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcfc2Q9D968 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcfc2Q9D968 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcfc2Q9D968 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcfc2Q9D968 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcfc2Q9D968 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms