Protein–RNA interactions for Protein: Q9D915

Tcim, Transcriptional and immune response regulator, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TcimQ9D915 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TcimQ9D915 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TcimQ9D915 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TcimQ9D915 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TcimQ9D915 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TcimQ9D915 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TcimQ9D915 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TcimQ9D915 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TcimQ9D915 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TcimQ9D915 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TcimQ9D915 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TcimQ9D915 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TcimQ9D915 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TcimQ9D915 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TcimQ9D915 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TcimQ9D915 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TcimQ9D915 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TcimQ9D915 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TcimQ9D915 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TcimQ9D915 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TcimQ9D915 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TcimQ9D915 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TcimQ9D915 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TcimQ9D915 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TcimQ9D915 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TcimQ9D915 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TcimQ9D915 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TcimQ9D915 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TcimQ9D915 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TcimQ9D915 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TcimQ9D915 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TcimQ9D915 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TcimQ9D915 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TcimQ9D915 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TcimQ9D915 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TcimQ9D915 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TcimQ9D915 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TcimQ9D915 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TcimQ9D915 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TcimQ9D915 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TcimQ9D915 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TcimQ9D915 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TcimQ9D915 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TcimQ9D915 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TcimQ9D915 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TcimQ9D915 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TcimQ9D915 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TcimQ9D915 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TcimQ9D915 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TcimQ9D915 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TcimQ9D915 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TcimQ9D915 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TcimQ9D915 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TcimQ9D915 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TcimQ9D915 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TcimQ9D915 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TcimQ9D915 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TcimQ9D915 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TcimQ9D915 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TcimQ9D915 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TcimQ9D915 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TcimQ9D915 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TcimQ9D915 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TcimQ9D915 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TcimQ9D915 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TcimQ9D915 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TcimQ9D915 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TcimQ9D915 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TcimQ9D915 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TcimQ9D915 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TcimQ9D915 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TcimQ9D915 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TcimQ9D915 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TcimQ9D915 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TcimQ9D915 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TcimQ9D915 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TcimQ9D915 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TcimQ9D915 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TcimQ9D915 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TcimQ9D915 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TcimQ9D915 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TcimQ9D915 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TcimQ9D915 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TcimQ9D915 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TcimQ9D915 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TcimQ9D915 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TcimQ9D915 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TcimQ9D915 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TcimQ9D915 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TcimQ9D915 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TcimQ9D915 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TcimQ9D915 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TcimQ9D915 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TcimQ9D915 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TcimQ9D915 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TcimQ9D915 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TcimQ9D915 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TcimQ9D915 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TcimQ9D915 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TcimQ9D915 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms