Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N6

Lin37, Protein lin-37 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin37Q9D8N6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lin37Q9D8N6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lin37Q9D8N6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lin37Q9D8N6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lin37Q9D8N6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lin37Q9D8N6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lin37Q9D8N6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lin37Q9D8N6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lin37Q9D8N6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lin37Q9D8N6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lin37Q9D8N6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lin37Q9D8N6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lin37Q9D8N6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lin37Q9D8N6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lin37Q9D8N6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lin37Q9D8N6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lin37Q9D8N6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lin37Q9D8N6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lin37Q9D8N6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Lin37Q9D8N6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lin37Q9D8N6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lin37Q9D8N6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lin37Q9D8N6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lin37Q9D8N6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lin37Q9D8N6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Lin37Q9D8N6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lin37Q9D8N6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lin37Q9D8N6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lin37Q9D8N6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lin37Q9D8N6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lin37Q9D8N6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lin37Q9D8N6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lin37Q9D8N6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lin37Q9D8N6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lin37Q9D8N6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lin37Q9D8N6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Lin37Q9D8N6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lin37Q9D8N6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lin37Q9D8N6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lin37Q9D8N6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lin37Q9D8N6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lin37Q9D8N6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lin37Q9D8N6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lin37Q9D8N6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lin37Q9D8N6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lin37Q9D8N6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lin37Q9D8N6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lin37Q9D8N6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lin37Q9D8N6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lin37Q9D8N6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lin37Q9D8N6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lin37Q9D8N6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lin37Q9D8N6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lin37Q9D8N6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lin37Q9D8N6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lin37Q9D8N6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lin37Q9D8N6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lin37Q9D8N6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lin37Q9D8N6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lin37Q9D8N6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lin37Q9D8N6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lin37Q9D8N6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lin37Q9D8N6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lin37Q9D8N6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lin37Q9D8N6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lin37Q9D8N6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lin37Q9D8N6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lin37Q9D8N6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lin37Q9D8N6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lin37Q9D8N6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lin37Q9D8N6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Lin37Q9D8N6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Lin37Q9D8N6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lin37Q9D8N6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lin37Q9D8N6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lin37Q9D8N6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lin37Q9D8N6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lin37Q9D8N6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lin37Q9D8N6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lin37Q9D8N6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Lin37Q9D8N6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lin37Q9D8N6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lin37Q9D8N6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lin37Q9D8N6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lin37Q9D8N6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lin37Q9D8N6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lin37Q9D8N6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lin37Q9D8N6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lin37Q9D8N6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lin37Q9D8N6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lin37Q9D8N6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lin37Q9D8N6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lin37Q9D8N6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lin37Q9D8N6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lin37Q9D8N6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Lin37Q9D8N6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lin37Q9D8N6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Lin37Q9D8N6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lin37Q9D8N6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lin37Q9D8N6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms