Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ifi35Q9D8C4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ifi35Q9D8C4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ifi35Q9D8C4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ifi35Q9D8C4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ifi35Q9D8C4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ifi35Q9D8C4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ifi35Q9D8C4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ifi35Q9D8C4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ifi35Q9D8C4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ifi35Q9D8C4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ifi35Q9D8C4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ifi35Q9D8C4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ifi35Q9D8C4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ifi35Q9D8C4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ifi35Q9D8C4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ifi35Q9D8C4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ifi35Q9D8C4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ifi35Q9D8C4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ifi35Q9D8C4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ifi35Q9D8C4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ifi35Q9D8C4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ifi35Q9D8C4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ifi35Q9D8C4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ifi35Q9D8C4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ifi35Q9D8C4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ifi35Q9D8C4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ifi35Q9D8C4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ifi35Q9D8C4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ifi35Q9D8C4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ifi35Q9D8C4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ifi35Q9D8C4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ifi35Q9D8C4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ifi35Q9D8C4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ifi35Q9D8C4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ifi35Q9D8C4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ifi35Q9D8C4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ifi35Q9D8C4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ifi35Q9D8C4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ifi35Q9D8C4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ifi35Q9D8C4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ifi35Q9D8C4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ifi35Q9D8C4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ifi35Q9D8C4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ifi35Q9D8C4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ifi35Q9D8C4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ifi35Q9D8C4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ifi35Q9D8C4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ifi35Q9D8C4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ifi35Q9D8C4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ifi35Q9D8C4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ifi35Q9D8C4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ifi35Q9D8C4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ifi35Q9D8C4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ifi35Q9D8C4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ifi35Q9D8C4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ifi35Q9D8C4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ifi35Q9D8C4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ifi35Q9D8C4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ifi35Q9D8C4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ifi35Q9D8C4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ifi35Q9D8C4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ifi35Q9D8C4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ifi35Q9D8C4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ifi35Q9D8C4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ifi35Q9D8C4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ifi35Q9D8C4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ifi35Q9D8C4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ifi35Q9D8C4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ifi35Q9D8C4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ifi35Q9D8C4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ifi35Q9D8C4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ifi35Q9D8C4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ifi35Q9D8C4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ifi35Q9D8C4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ifi35Q9D8C4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ifi35Q9D8C4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ifi35Q9D8C4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ifi35Q9D8C4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ifi35Q9D8C4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ifi35Q9D8C4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ifi35Q9D8C4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ifi35Q9D8C4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ifi35Q9D8C4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ifi35Q9D8C4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ifi35Q9D8C4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ifi35Q9D8C4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ifi35Q9D8C4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ifi35Q9D8C4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ifi35Q9D8C4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ifi35Q9D8C4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ifi35Q9D8C4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ifi35Q9D8C4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ifi35Q9D8C4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ifi35Q9D8C4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ifi35Q9D8C4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ifi35Q9D8C4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ifi35Q9D8C4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ifi35Q9D8C4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ifi35Q9D8C4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms