Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Chmp4bQ9D8B3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Chmp4bQ9D8B3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Chmp4bQ9D8B3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Chmp4bQ9D8B3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Chmp4bQ9D8B3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Chmp4bQ9D8B3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Chmp4bQ9D8B3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Chmp4bQ9D8B3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Chmp4bQ9D8B3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Chmp4bQ9D8B3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Chmp4bQ9D8B3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Chmp4bQ9D8B3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Chmp4bQ9D8B3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Chmp4bQ9D8B3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Chmp4bQ9D8B3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Chmp4bQ9D8B3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Chmp4bQ9D8B3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Chmp4bQ9D8B3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Chmp4bQ9D8B3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Chmp4bQ9D8B3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Chmp4bQ9D8B3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Chmp4bQ9D8B3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Chmp4bQ9D8B3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Chmp4bQ9D8B3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Chmp4bQ9D8B3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Chmp4bQ9D8B3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Chmp4bQ9D8B3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Chmp4bQ9D8B3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Chmp4bQ9D8B3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Chmp4bQ9D8B3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Chmp4bQ9D8B3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Chmp4bQ9D8B3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Chmp4bQ9D8B3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Chmp4bQ9D8B3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Chmp4bQ9D8B3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Chmp4bQ9D8B3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Chmp4bQ9D8B3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Chmp4bQ9D8B3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Chmp4bQ9D8B3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Chmp4bQ9D8B3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Chmp4bQ9D8B3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Chmp4bQ9D8B3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Chmp4bQ9D8B3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Chmp4bQ9D8B3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Chmp4bQ9D8B3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Chmp4bQ9D8B3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Chmp4bQ9D8B3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Chmp4bQ9D8B3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Chmp4bQ9D8B3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Chmp4bQ9D8B3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Chmp4bQ9D8B3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Chmp4bQ9D8B3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Chmp4bQ9D8B3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Chmp4bQ9D8B3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Chmp4bQ9D8B3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Chmp4bQ9D8B3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Chmp4bQ9D8B3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Chmp4bQ9D8B3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Chmp4bQ9D8B3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Chmp4bQ9D8B3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Chmp4bQ9D8B3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Chmp4bQ9D8B3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Chmp4bQ9D8B3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Chmp4bQ9D8B3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Chmp4bQ9D8B3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Chmp4bQ9D8B3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Chmp4bQ9D8B3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Chmp4bQ9D8B3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Chmp4bQ9D8B3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Chmp4bQ9D8B3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Chmp4bQ9D8B3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Chmp4bQ9D8B3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Chmp4bQ9D8B3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Chmp4bQ9D8B3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Chmp4bQ9D8B3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Chmp4bQ9D8B3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Chmp4bQ9D8B3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Chmp4bQ9D8B3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Chmp4bQ9D8B3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Chmp4bQ9D8B3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Chmp4bQ9D8B3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Chmp4bQ9D8B3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Chmp4bQ9D8B3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Chmp4bQ9D8B3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Chmp4bQ9D8B3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Chmp4bQ9D8B3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Chmp4bQ9D8B3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Chmp4bQ9D8B3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Chmp4bQ9D8B3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Chmp4bQ9D8B3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Chmp4bQ9D8B3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Chmp4bQ9D8B3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Chmp4bQ9D8B3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Chmp4bQ9D8B3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Chmp4bQ9D8B3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Chmp4bQ9D8B3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Chmp4bQ9D8B3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Chmp4bQ9D8B3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Chmp4bQ9D8B3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms