Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Capns2Q9D7J7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Capns2Q9D7J7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Capns2Q9D7J7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Capns2Q9D7J7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Capns2Q9D7J7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Capns2Q9D7J7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Capns2Q9D7J7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Capns2Q9D7J7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Capns2Q9D7J7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Capns2Q9D7J7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Capns2Q9D7J7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Capns2Q9D7J7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Capns2Q9D7J7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Capns2Q9D7J7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Capns2Q9D7J7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Capns2Q9D7J7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Capns2Q9D7J7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Capns2Q9D7J7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Capns2Q9D7J7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Capns2Q9D7J7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Capns2Q9D7J7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Capns2Q9D7J7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Capns2Q9D7J7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Capns2Q9D7J7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Capns2Q9D7J7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Capns2Q9D7J7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Capns2Q9D7J7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Capns2Q9D7J7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Capns2Q9D7J7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Capns2Q9D7J7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Capns2Q9D7J7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Capns2Q9D7J7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Capns2Q9D7J7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Capns2Q9D7J7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Capns2Q9D7J7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Capns2Q9D7J7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Capns2Q9D7J7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Capns2Q9D7J7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Capns2Q9D7J7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Capns2Q9D7J7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Capns2Q9D7J7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Capns2Q9D7J7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Capns2Q9D7J7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Capns2Q9D7J7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Capns2Q9D7J7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capns2Q9D7J7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capns2Q9D7J7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capns2Q9D7J7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capns2Q9D7J7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capns2Q9D7J7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capns2Q9D7J7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capns2Q9D7J7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Capns2Q9D7J7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Capns2Q9D7J7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Capns2Q9D7J7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Capns2Q9D7J7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Capns2Q9D7J7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Capns2Q9D7J7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Capns2Q9D7J7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Capns2Q9D7J7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Capns2Q9D7J7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Capns2Q9D7J7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Capns2Q9D7J7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Capns2Q9D7J7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Capns2Q9D7J7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Capns2Q9D7J7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Capns2Q9D7J7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Capns2Q9D7J7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capns2Q9D7J7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capns2Q9D7J7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capns2Q9D7J7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capns2Q9D7J7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capns2Q9D7J7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capns2Q9D7J7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capns2Q9D7J7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capns2Q9D7J7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capns2Q9D7J7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capns2Q9D7J7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Capns2Q9D7J7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Capns2Q9D7J7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Capns2Q9D7J7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Capns2Q9D7J7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Capns2Q9D7J7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Capns2Q9D7J7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Capns2Q9D7J7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Capns2Q9D7J7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Capns2Q9D7J7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Capns2Q9D7J7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Capns2Q9D7J7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Capns2Q9D7J7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Capns2Q9D7J7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Capns2Q9D7J7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Capns2Q9D7J7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Capns2Q9D7J7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Capns2Q9D7J7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Capns2Q9D7J7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Capns2Q9D7J7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Capns2Q9D7J7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Capns2Q9D7J7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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