Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Gbe1Q9D6Y9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Gbe1Q9D6Y9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gbe1Q9D6Y9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gbe1Q9D6Y9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gbe1Q9D6Y9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Gbe1Q9D6Y9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gbe1Q9D6Y9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gbe1Q9D6Y9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gbe1Q9D6Y9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gbe1Q9D6Y9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gbe1Q9D6Y9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gbe1Q9D6Y9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gbe1Q9D6Y9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gbe1Q9D6Y9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gbe1Q9D6Y9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbe1Q9D6Y9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbe1Q9D6Y9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbe1Q9D6Y9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbe1Q9D6Y9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbe1Q9D6Y9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbe1Q9D6Y9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbe1Q9D6Y9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbe1Q9D6Y9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbe1Q9D6Y9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbe1Q9D6Y9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbe1Q9D6Y9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbe1Q9D6Y9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gbe1Q9D6Y9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gbe1Q9D6Y9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gbe1Q9D6Y9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Gbe1Q9D6Y9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Gbe1Q9D6Y9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gbe1Q9D6Y9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gbe1Q9D6Y9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gbe1Q9D6Y9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gbe1Q9D6Y9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gbe1Q9D6Y9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gbe1Q9D6Y9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gbe1Q9D6Y9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Gbe1Q9D6Y9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gbe1Q9D6Y9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gbe1Q9D6Y9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gbe1Q9D6Y9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gbe1Q9D6Y9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gbe1Q9D6Y9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gbe1Q9D6Y9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Gbe1Q9D6Y9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Gbe1Q9D6Y9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gbe1Q9D6Y9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gbe1Q9D6Y9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gbe1Q9D6Y9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gbe1Q9D6Y9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gbe1Q9D6Y9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gbe1Q9D6Y9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gbe1Q9D6Y9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gbe1Q9D6Y9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gbe1Q9D6Y9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gbe1Q9D6Y9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gbe1Q9D6Y9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gbe1Q9D6Y9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gbe1Q9D6Y9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gbe1Q9D6Y9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbe1Q9D6Y9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbe1Q9D6Y9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbe1Q9D6Y9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbe1Q9D6Y9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbe1Q9D6Y9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbe1Q9D6Y9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbe1Q9D6Y9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbe1Q9D6Y9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbe1Q9D6Y9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbe1Q9D6Y9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbe1Q9D6Y9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbe1Q9D6Y9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbe1Q9D6Y9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbe1Q9D6Y9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbe1Q9D6Y9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbe1Q9D6Y9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbe1Q9D6Y9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbe1Q9D6Y9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbe1Q9D6Y9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbe1Q9D6Y9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbe1Q9D6Y9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gbe1Q9D6Y9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gbe1Q9D6Y9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gbe1Q9D6Y9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gbe1Q9D6Y9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gbe1Q9D6Y9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gbe1Q9D6Y9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gbe1Q9D6Y9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gbe1Q9D6Y9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gbe1Q9D6Y9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gbe1Q9D6Y9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Gbe1Q9D6Y9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gbe1Q9D6Y9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gbe1Q9D6Y9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Gbe1Q9D6Y9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gbe1Q9D6Y9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gbe1Q9D6Y9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms