Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6T1

Tube1, Tubulin epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tube1Q9D6T1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tube1Q9D6T1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tube1Q9D6T1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Tube1Q9D6T1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tube1Q9D6T1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tube1Q9D6T1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tube1Q9D6T1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tube1Q9D6T1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tube1Q9D6T1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tube1Q9D6T1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tube1Q9D6T1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tube1Q9D6T1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tube1Q9D6T1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tube1Q9D6T1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tube1Q9D6T1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tube1Q9D6T1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tube1Q9D6T1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Tube1Q9D6T1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tube1Q9D6T1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Tube1Q9D6T1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tube1Q9D6T1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tube1Q9D6T1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tube1Q9D6T1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tube1Q9D6T1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tube1Q9D6T1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tube1Q9D6T1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tube1Q9D6T1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tube1Q9D6T1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tube1Q9D6T1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tube1Q9D6T1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tube1Q9D6T1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tube1Q9D6T1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tube1Q9D6T1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tube1Q9D6T1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tube1Q9D6T1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tube1Q9D6T1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Tube1Q9D6T1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tube1Q9D6T1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tube1Q9D6T1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tube1Q9D6T1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tube1Q9D6T1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tube1Q9D6T1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tube1Q9D6T1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tube1Q9D6T1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tube1Q9D6T1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tube1Q9D6T1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tube1Q9D6T1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tube1Q9D6T1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tube1Q9D6T1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tube1Q9D6T1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tube1Q9D6T1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tube1Q9D6T1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tube1Q9D6T1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Tube1Q9D6T1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tube1Q9D6T1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tube1Q9D6T1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tube1Q9D6T1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tube1Q9D6T1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tube1Q9D6T1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tube1Q9D6T1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tube1Q9D6T1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Tube1Q9D6T1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tube1Q9D6T1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tube1Q9D6T1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tube1Q9D6T1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tube1Q9D6T1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tube1Q9D6T1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tube1Q9D6T1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tube1Q9D6T1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tube1Q9D6T1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Tube1Q9D6T1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tube1Q9D6T1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tube1Q9D6T1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tube1Q9D6T1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tube1Q9D6T1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tube1Q9D6T1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tube1Q9D6T1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tube1Q9D6T1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tube1Q9D6T1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tube1Q9D6T1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tube1Q9D6T1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Tube1Q9D6T1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Tube1Q9D6T1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tube1Q9D6T1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tube1Q9D6T1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tube1Q9D6T1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tube1Q9D6T1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tube1Q9D6T1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tube1Q9D6T1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Tube1Q9D6T1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tube1Q9D6T1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tube1Q9D6T1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tube1Q9D6T1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tube1Q9D6T1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tube1Q9D6T1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tube1Q9D6T1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tube1Q9D6T1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tube1Q9D6T1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tube1Q9D6T1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tube1Q9D6T1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms