Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5L7

Spsb1, SPRY domain-containing SOCS box protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb1Q9D5L7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spsb1Q9D5L7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spsb1Q9D5L7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spsb1Q9D5L7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spsb1Q9D5L7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spsb1Q9D5L7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spsb1Q9D5L7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spsb1Q9D5L7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spsb1Q9D5L7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spsb1Q9D5L7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spsb1Q9D5L7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spsb1Q9D5L7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spsb1Q9D5L7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spsb1Q9D5L7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spsb1Q9D5L7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spsb1Q9D5L7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spsb1Q9D5L7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Spsb1Q9D5L7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Spsb1Q9D5L7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spsb1Q9D5L7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spsb1Q9D5L7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spsb1Q9D5L7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spsb1Q9D5L7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spsb1Q9D5L7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spsb1Q9D5L7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spsb1Q9D5L7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Spsb1Q9D5L7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spsb1Q9D5L7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spsb1Q9D5L7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spsb1Q9D5L7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Spsb1Q9D5L7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Spsb1Q9D5L7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Spsb1Q9D5L7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Spsb1Q9D5L7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Spsb1Q9D5L7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Spsb1Q9D5L7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spsb1Q9D5L7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spsb1Q9D5L7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spsb1Q9D5L7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spsb1Q9D5L7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spsb1Q9D5L7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spsb1Q9D5L7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spsb1Q9D5L7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Spsb1Q9D5L7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spsb1Q9D5L7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spsb1Q9D5L7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spsb1Q9D5L7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spsb1Q9D5L7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spsb1Q9D5L7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spsb1Q9D5L7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spsb1Q9D5L7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spsb1Q9D5L7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spsb1Q9D5L7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spsb1Q9D5L7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spsb1Q9D5L7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spsb1Q9D5L7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spsb1Q9D5L7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spsb1Q9D5L7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spsb1Q9D5L7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spsb1Q9D5L7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spsb1Q9D5L7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spsb1Q9D5L7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spsb1Q9D5L7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spsb1Q9D5L7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spsb1Q9D5L7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spsb1Q9D5L7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spsb1Q9D5L7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spsb1Q9D5L7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spsb1Q9D5L7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spsb1Q9D5L7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spsb1Q9D5L7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spsb1Q9D5L7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spsb1Q9D5L7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spsb1Q9D5L7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spsb1Q9D5L7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spsb1Q9D5L7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spsb1Q9D5L7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spsb1Q9D5L7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spsb1Q9D5L7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spsb1Q9D5L7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spsb1Q9D5L7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spsb1Q9D5L7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spsb1Q9D5L7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spsb1Q9D5L7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spsb1Q9D5L7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spsb1Q9D5L7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spsb1Q9D5L7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spsb1Q9D5L7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spsb1Q9D5L7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spsb1Q9D5L7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Spsb1Q9D5L7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spsb1Q9D5L7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spsb1Q9D5L7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spsb1Q9D5L7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spsb1Q9D5L7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spsb1Q9D5L7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spsb1Q9D5L7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Spsb1Q9D5L7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spsb1Q9D5L7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spsb1Q9D5L7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms