Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Y3

Rhox2a, Reproductive homeobox 2A, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox2aQ9D4Y3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rhox2aQ9D4Y3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Rhox2aQ9D4Y3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rhox2aQ9D4Y3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rhox2aQ9D4Y3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rhox2aQ9D4Y3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rhox2aQ9D4Y3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rhox2aQ9D4Y3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rhox2aQ9D4Y3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rhox2aQ9D4Y3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rhox2aQ9D4Y3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rhox2aQ9D4Y3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rhox2aQ9D4Y3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rhox2aQ9D4Y3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Rhox2aQ9D4Y3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rhox2aQ9D4Y3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rhox2aQ9D4Y3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rhox2aQ9D4Y3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rhox2aQ9D4Y3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rhox2aQ9D4Y3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rhox2aQ9D4Y3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rhox2aQ9D4Y3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rhox2aQ9D4Y3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rhox2aQ9D4Y3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rhox2aQ9D4Y3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rhox2aQ9D4Y3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rhox2aQ9D4Y3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rhox2aQ9D4Y3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rhox2aQ9D4Y3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rhox2aQ9D4Y3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rhox2aQ9D4Y3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rhox2aQ9D4Y3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rhox2aQ9D4Y3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rhox2aQ9D4Y3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rhox2aQ9D4Y3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rhox2aQ9D4Y3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rhox2aQ9D4Y3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rhox2aQ9D4Y3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rhox2aQ9D4Y3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rhox2aQ9D4Y3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rhox2aQ9D4Y3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Rhox2aQ9D4Y3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rhox2aQ9D4Y3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rhox2aQ9D4Y3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rhox2aQ9D4Y3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rhox2aQ9D4Y3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rhox2aQ9D4Y3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rhox2aQ9D4Y3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rhox2aQ9D4Y3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rhox2aQ9D4Y3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rhox2aQ9D4Y3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rhox2aQ9D4Y3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rhox2aQ9D4Y3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rhox2aQ9D4Y3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rhox2aQ9D4Y3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rhox2aQ9D4Y3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rhox2aQ9D4Y3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Rhox2aQ9D4Y3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rhox2aQ9D4Y3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rhox2aQ9D4Y3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rhox2aQ9D4Y3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rhox2aQ9D4Y3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rhox2aQ9D4Y3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rhox2aQ9D4Y3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rhox2aQ9D4Y3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rhox2aQ9D4Y3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rhox2aQ9D4Y3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rhox2aQ9D4Y3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Rhox2aQ9D4Y3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rhox2aQ9D4Y3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rhox2aQ9D4Y3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rhox2aQ9D4Y3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rhox2aQ9D4Y3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rhox2aQ9D4Y3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rhox2aQ9D4Y3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rhox2aQ9D4Y3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rhox2aQ9D4Y3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rhox2aQ9D4Y3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rhox2aQ9D4Y3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rhox2aQ9D4Y3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rhox2aQ9D4Y3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rhox2aQ9D4Y3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rhox2aQ9D4Y3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rhox2aQ9D4Y3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rhox2aQ9D4Y3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Rhox2aQ9D4Y3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rhox2aQ9D4Y3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rhox2aQ9D4Y3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rhox2aQ9D4Y3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rhox2aQ9D4Y3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rhox2aQ9D4Y3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rhox2aQ9D4Y3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rhox2aQ9D4Y3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rhox2aQ9D4Y3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Rhox2aQ9D4Y3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Rhox2aQ9D4Y3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rhox2aQ9D4Y3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rhox2aQ9D4Y3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rhox2aQ9D4Y3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Rhox2aQ9D4Y3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms