Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc83Q9D4V3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc83Q9D4V3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc83Q9D4V3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc83Q9D4V3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc83Q9D4V3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc83Q9D4V3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc83Q9D4V3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc83Q9D4V3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc83Q9D4V3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc83Q9D4V3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc83Q9D4V3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc83Q9D4V3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc83Q9D4V3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc83Q9D4V3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc83Q9D4V3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc83Q9D4V3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc83Q9D4V3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc83Q9D4V3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc83Q9D4V3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc83Q9D4V3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc83Q9D4V3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc83Q9D4V3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc83Q9D4V3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc83Q9D4V3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc83Q9D4V3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc83Q9D4V3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc83Q9D4V3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc83Q9D4V3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc83Q9D4V3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc83Q9D4V3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc83Q9D4V3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc83Q9D4V3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc83Q9D4V3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc83Q9D4V3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc83Q9D4V3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc83Q9D4V3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc83Q9D4V3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc83Q9D4V3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc83Q9D4V3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc83Q9D4V3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc83Q9D4V3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc83Q9D4V3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc83Q9D4V3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc83Q9D4V3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc83Q9D4V3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc83Q9D4V3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc83Q9D4V3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc83Q9D4V3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc83Q9D4V3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc83Q9D4V3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc83Q9D4V3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc83Q9D4V3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc83Q9D4V3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc83Q9D4V3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc83Q9D4V3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc83Q9D4V3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc83Q9D4V3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc83Q9D4V3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc83Q9D4V3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc83Q9D4V3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc83Q9D4V3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc83Q9D4V3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc83Q9D4V3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc83Q9D4V3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc83Q9D4V3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc83Q9D4V3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc83Q9D4V3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc83Q9D4V3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc83Q9D4V3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc83Q9D4V3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc83Q9D4V3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc83Q9D4V3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc83Q9D4V3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc83Q9D4V3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc83Q9D4V3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc83Q9D4V3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc83Q9D4V3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc83Q9D4V3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc83Q9D4V3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc83Q9D4V3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc83Q9D4V3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc83Q9D4V3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc83Q9D4V3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc83Q9D4V3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc83Q9D4V3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc83Q9D4V3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc83Q9D4V3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc83Q9D4V3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc83Q9D4V3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc83Q9D4V3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc83Q9D4V3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc83Q9D4V3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc83Q9D4V3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc83Q9D4V3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc83Q9D4V3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc83Q9D4V3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc83Q9D4V3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc83Q9D4V3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc83Q9D4V3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms