Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U4

H2al3, H2A histone family member L3, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al3Q9D4U4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2al3Q9D4U4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2al3Q9D4U4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2al3Q9D4U4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2al3Q9D4U4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
H2al3Q9D4U4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2al3Q9D4U4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2al3Q9D4U4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
H2al3Q9D4U4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2al3Q9D4U4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2al3Q9D4U4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2al3Q9D4U4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2al3Q9D4U4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2al3Q9D4U4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2al3Q9D4U4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2al3Q9D4U4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
H2al3Q9D4U4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2al3Q9D4U4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2al3Q9D4U4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
H2al3Q9D4U4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2al3Q9D4U4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2al3Q9D4U4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2al3Q9D4U4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2al3Q9D4U4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2al3Q9D4U4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2al3Q9D4U4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
H2al3Q9D4U4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2al3Q9D4U4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2al3Q9D4U4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2al3Q9D4U4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2al3Q9D4U4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2al3Q9D4U4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2al3Q9D4U4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2al3Q9D4U4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2al3Q9D4U4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2al3Q9D4U4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2al3Q9D4U4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
H2al3Q9D4U4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2al3Q9D4U4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2al3Q9D4U4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2al3Q9D4U4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2al3Q9D4U4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2al3Q9D4U4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2al3Q9D4U4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2al3Q9D4U4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2al3Q9D4U4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2al3Q9D4U4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2al3Q9D4U4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2al3Q9D4U4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2al3Q9D4U4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2al3Q9D4U4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2al3Q9D4U4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2al3Q9D4U4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2al3Q9D4U4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2al3Q9D4U4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
H2al3Q9D4U4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2al3Q9D4U4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2al3Q9D4U4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2al3Q9D4U4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2al3Q9D4U4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2al3Q9D4U4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2al3Q9D4U4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2al3Q9D4U4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2al3Q9D4U4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2al3Q9D4U4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2al3Q9D4U4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2al3Q9D4U4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2al3Q9D4U4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2al3Q9D4U4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2al3Q9D4U4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2al3Q9D4U4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2al3Q9D4U4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2al3Q9D4U4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2al3Q9D4U4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2al3Q9D4U4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2al3Q9D4U4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2al3Q9D4U4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2al3Q9D4U4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2al3Q9D4U4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2al3Q9D4U4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2al3Q9D4U4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2al3Q9D4U4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2al3Q9D4U4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2al3Q9D4U4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2al3Q9D4U4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2al3Q9D4U4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2al3Q9D4U4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2al3Q9D4U4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2al3Q9D4U4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2al3Q9D4U4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2al3Q9D4U4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2al3Q9D4U4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2al3Q9D4U4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2al3Q9D4U4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2al3Q9D4U4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2al3Q9D4U4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2al3Q9D4U4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2al3Q9D4U4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2al3Q9D4U4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2al3Q9D4U4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms