Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D2

4933402E13Rik, 4933402E13Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933402E13RikQ9D4D2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
4933402E13RikQ9D4D2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
4933402E13RikQ9D4D2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
4933402E13RikQ9D4D2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
4933402E13RikQ9D4D2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
4933402E13RikQ9D4D2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
4933402E13RikQ9D4D2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
4933402E13RikQ9D4D2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
4933402E13RikQ9D4D2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
4933402E13RikQ9D4D2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
4933402E13RikQ9D4D2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
4933402E13RikQ9D4D2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
4933402E13RikQ9D4D2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
4933402E13RikQ9D4D2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
4933402E13RikQ9D4D2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
4933402E13RikQ9D4D2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
4933402E13RikQ9D4D2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
4933402E13RikQ9D4D2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
4933402E13RikQ9D4D2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
4933402E13RikQ9D4D2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
4933402E13RikQ9D4D2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
4933402E13RikQ9D4D2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
4933402E13RikQ9D4D2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
4933402E13RikQ9D4D2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
4933402E13RikQ9D4D2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
4933402E13RikQ9D4D2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
4933402E13RikQ9D4D2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
4933402E13RikQ9D4D2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
4933402E13RikQ9D4D2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
4933402E13RikQ9D4D2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
4933402E13RikQ9D4D2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
4933402E13RikQ9D4D2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
4933402E13RikQ9D4D2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
4933402E13RikQ9D4D2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
4933402E13RikQ9D4D2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
4933402E13RikQ9D4D2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
4933402E13RikQ9D4D2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
4933402E13RikQ9D4D2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
4933402E13RikQ9D4D2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
4933402E13RikQ9D4D2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
4933402E13RikQ9D4D2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
4933402E13RikQ9D4D2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
4933402E13RikQ9D4D2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
4933402E13RikQ9D4D2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
4933402E13RikQ9D4D2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
4933402E13RikQ9D4D2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
4933402E13RikQ9D4D2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
4933402E13RikQ9D4D2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
4933402E13RikQ9D4D2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
4933402E13RikQ9D4D2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
4933402E13RikQ9D4D2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
4933402E13RikQ9D4D2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
4933402E13RikQ9D4D2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
4933402E13RikQ9D4D2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
4933402E13RikQ9D4D2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
4933402E13RikQ9D4D2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
4933402E13RikQ9D4D2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
4933402E13RikQ9D4D2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
4933402E13RikQ9D4D2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
4933402E13RikQ9D4D2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
4933402E13RikQ9D4D2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
4933402E13RikQ9D4D2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
4933402E13RikQ9D4D2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
4933402E13RikQ9D4D2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
4933402E13RikQ9D4D2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
4933402E13RikQ9D4D2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
4933402E13RikQ9D4D2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
4933402E13RikQ9D4D2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
4933402E13RikQ9D4D2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
4933402E13RikQ9D4D2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
4933402E13RikQ9D4D2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
4933402E13RikQ9D4D2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
4933402E13RikQ9D4D2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
4933402E13RikQ9D4D2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
4933402E13RikQ9D4D2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
4933402E13RikQ9D4D2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
4933402E13RikQ9D4D2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
4933402E13RikQ9D4D2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
4933402E13RikQ9D4D2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
4933402E13RikQ9D4D2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
4933402E13RikQ9D4D2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
4933402E13RikQ9D4D2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
4933402E13RikQ9D4D2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
4933402E13RikQ9D4D2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
4933402E13RikQ9D4D2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
4933402E13RikQ9D4D2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
4933402E13RikQ9D4D2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
4933402E13RikQ9D4D2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
4933402E13RikQ9D4D2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
4933402E13RikQ9D4D2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
4933402E13RikQ9D4D2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
4933402E13RikQ9D4D2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
4933402E13RikQ9D4D2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
4933402E13RikQ9D4D2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
4933402E13RikQ9D4D2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
4933402E13RikQ9D4D2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
4933402E13RikQ9D4D2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
4933402E13RikQ9D4D2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
4933402E13RikQ9D4D2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
4933402E13RikQ9D4D2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms