Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snrnp35Q9D384 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snrnp35Q9D384 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snrnp35Q9D384 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snrnp35Q9D384 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snrnp35Q9D384 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snrnp35Q9D384 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snrnp35Q9D384 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snrnp35Q9D384 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snrnp35Q9D384 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snrnp35Q9D384 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Snrnp35Q9D384 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snrnp35Q9D384 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snrnp35Q9D384 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snrnp35Q9D384 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snrnp35Q9D384 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snrnp35Q9D384 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snrnp35Q9D384 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snrnp35Q9D384 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snrnp35Q9D384 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snrnp35Q9D384 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snrnp35Q9D384 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snrnp35Q9D384 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snrnp35Q9D384 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snrnp35Q9D384 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snrnp35Q9D384 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snrnp35Q9D384 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snrnp35Q9D384 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Snrnp35Q9D384 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snrnp35Q9D384 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snrnp35Q9D384 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snrnp35Q9D384 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snrnp35Q9D384 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snrnp35Q9D384 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snrnp35Q9D384 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Snrnp35Q9D384 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snrnp35Q9D384 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Snrnp35Q9D384 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Snrnp35Q9D384 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snrnp35Q9D384 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snrnp35Q9D384 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snrnp35Q9D384 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snrnp35Q9D384 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snrnp35Q9D384 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snrnp35Q9D384 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snrnp35Q9D384 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Snrnp35Q9D384 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Snrnp35Q9D384 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snrnp35Q9D384 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snrnp35Q9D384 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snrnp35Q9D384 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snrnp35Q9D384 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snrnp35Q9D384 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snrnp35Q9D384 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snrnp35Q9D384 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snrnp35Q9D384 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snrnp35Q9D384 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snrnp35Q9D384 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snrnp35Q9D384 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snrnp35Q9D384 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snrnp35Q9D384 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snrnp35Q9D384 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snrnp35Q9D384 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snrnp35Q9D384 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snrnp35Q9D384 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Snrnp35Q9D384 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snrnp35Q9D384 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snrnp35Q9D384 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snrnp35Q9D384 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snrnp35Q9D384 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snrnp35Q9D384 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snrnp35Q9D384 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snrnp35Q9D384 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snrnp35Q9D384 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Snrnp35Q9D384 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snrnp35Q9D384 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snrnp35Q9D384 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snrnp35Q9D384 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Snrnp35Q9D384 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Snrnp35Q9D384 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Snrnp35Q9D384 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snrnp35Q9D384 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snrnp35Q9D384 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snrnp35Q9D384 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snrnp35Q9D384 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snrnp35Q9D384 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snrnp35Q9D384 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snrnp35Q9D384 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snrnp35Q9D384 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Snrnp35Q9D384 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snrnp35Q9D384 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snrnp35Q9D384 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Snrnp35Q9D384 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snrnp35Q9D384 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snrnp35Q9D384 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snrnp35Q9D384 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snrnp35Q9D384 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snrnp35Q9D384 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snrnp35Q9D384 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snrnp35Q9D384 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.1 ms