Protein–RNA interactions for Protein: Q9D275

Batf3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Batf3Q9D275 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Batf3Q9D275 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Batf3Q9D275 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Batf3Q9D275 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Batf3Q9D275 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Batf3Q9D275 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Batf3Q9D275 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Batf3Q9D275 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Batf3Q9D275 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Batf3Q9D275 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Batf3Q9D275 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Batf3Q9D275 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Batf3Q9D275 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Batf3Q9D275 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Batf3Q9D275 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Batf3Q9D275 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Batf3Q9D275 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Batf3Q9D275 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Batf3Q9D275 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Batf3Q9D275 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Batf3Q9D275 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Batf3Q9D275 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Batf3Q9D275 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Batf3Q9D275 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Batf3Q9D275 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Batf3Q9D275 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Batf3Q9D275 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Batf3Q9D275 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Batf3Q9D275 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Batf3Q9D275 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Batf3Q9D275 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Batf3Q9D275 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Batf3Q9D275 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Batf3Q9D275 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Batf3Q9D275 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Batf3Q9D275 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Batf3Q9D275 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Batf3Q9D275 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Batf3Q9D275 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Batf3Q9D275 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Batf3Q9D275 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Batf3Q9D275 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Batf3Q9D275 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Batf3Q9D275 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Batf3Q9D275 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Batf3Q9D275 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Batf3Q9D275 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Batf3Q9D275 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Batf3Q9D275 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Batf3Q9D275 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Batf3Q9D275 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Batf3Q9D275 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Batf3Q9D275 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Batf3Q9D275 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Batf3Q9D275 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Batf3Q9D275 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Batf3Q9D275 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Batf3Q9D275 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Batf3Q9D275 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Batf3Q9D275 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Batf3Q9D275 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Batf3Q9D275 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Batf3Q9D275 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Batf3Q9D275 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Batf3Q9D275 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Batf3Q9D275 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Batf3Q9D275 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Batf3Q9D275 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Batf3Q9D275 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Batf3Q9D275 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Batf3Q9D275 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Batf3Q9D275 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Batf3Q9D275 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Batf3Q9D275 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Batf3Q9D275 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Batf3Q9D275 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Batf3Q9D275 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Batf3Q9D275 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Batf3Q9D275 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Batf3Q9D275 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Batf3Q9D275 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Batf3Q9D275 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Batf3Q9D275 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Batf3Q9D275 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Batf3Q9D275 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Batf3Q9D275 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Batf3Q9D275 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Batf3Q9D275 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Batf3Q9D275 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Batf3Q9D275 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Batf3Q9D275 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Batf3Q9D275 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Batf3Q9D275 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Batf3Q9D275 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Batf3Q9D275 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Batf3Q9D275 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Batf3Q9D275 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Batf3Q9D275 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Batf3Q9D275 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Batf3Q9D275 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms