Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F0

Rtl8b, CAAX box 1 homolog A (Human), mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl8bQ9D1F0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rtl8bQ9D1F0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rtl8bQ9D1F0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rtl8bQ9D1F0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rtl8bQ9D1F0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rtl8bQ9D1F0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rtl8bQ9D1F0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rtl8bQ9D1F0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rtl8bQ9D1F0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rtl8bQ9D1F0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rtl8bQ9D1F0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rtl8bQ9D1F0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rtl8bQ9D1F0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rtl8bQ9D1F0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rtl8bQ9D1F0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rtl8bQ9D1F0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rtl8bQ9D1F0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rtl8bQ9D1F0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rtl8bQ9D1F0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rtl8bQ9D1F0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rtl8bQ9D1F0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rtl8bQ9D1F0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rtl8bQ9D1F0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rtl8bQ9D1F0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rtl8bQ9D1F0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rtl8bQ9D1F0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rtl8bQ9D1F0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rtl8bQ9D1F0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rtl8bQ9D1F0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rtl8bQ9D1F0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rtl8bQ9D1F0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rtl8bQ9D1F0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rtl8bQ9D1F0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rtl8bQ9D1F0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rtl8bQ9D1F0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rtl8bQ9D1F0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rtl8bQ9D1F0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rtl8bQ9D1F0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rtl8bQ9D1F0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rtl8bQ9D1F0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rtl8bQ9D1F0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rtl8bQ9D1F0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rtl8bQ9D1F0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rtl8bQ9D1F0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rtl8bQ9D1F0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rtl8bQ9D1F0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rtl8bQ9D1F0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rtl8bQ9D1F0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rtl8bQ9D1F0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rtl8bQ9D1F0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rtl8bQ9D1F0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rtl8bQ9D1F0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rtl8bQ9D1F0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rtl8bQ9D1F0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rtl8bQ9D1F0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rtl8bQ9D1F0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rtl8bQ9D1F0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rtl8bQ9D1F0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rtl8bQ9D1F0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rtl8bQ9D1F0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rtl8bQ9D1F0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rtl8bQ9D1F0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rtl8bQ9D1F0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rtl8bQ9D1F0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rtl8bQ9D1F0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rtl8bQ9D1F0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rtl8bQ9D1F0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rtl8bQ9D1F0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rtl8bQ9D1F0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rtl8bQ9D1F0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rtl8bQ9D1F0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rtl8bQ9D1F0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rtl8bQ9D1F0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rtl8bQ9D1F0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rtl8bQ9D1F0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rtl8bQ9D1F0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rtl8bQ9D1F0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rtl8bQ9D1F0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rtl8bQ9D1F0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rtl8bQ9D1F0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rtl8bQ9D1F0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rtl8bQ9D1F0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rtl8bQ9D1F0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rtl8bQ9D1F0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rtl8bQ9D1F0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rtl8bQ9D1F0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rtl8bQ9D1F0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rtl8bQ9D1F0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rtl8bQ9D1F0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rtl8bQ9D1F0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rtl8bQ9D1F0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rtl8bQ9D1F0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rtl8bQ9D1F0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rtl8bQ9D1F0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rtl8bQ9D1F0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rtl8bQ9D1F0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rtl8bQ9D1F0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rtl8bQ9D1F0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rtl8bQ9D1F0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rtl8bQ9D1F0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms