Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B6

Pbdc1, Protein PBDC1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbdc1Q9D0B6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pbdc1Q9D0B6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Pbdc1Q9D0B6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pbdc1Q9D0B6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pbdc1Q9D0B6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Pbdc1Q9D0B6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pbdc1Q9D0B6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pbdc1Q9D0B6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pbdc1Q9D0B6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pbdc1Q9D0B6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pbdc1Q9D0B6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pbdc1Q9D0B6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pbdc1Q9D0B6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pbdc1Q9D0B6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pbdc1Q9D0B6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pbdc1Q9D0B6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pbdc1Q9D0B6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pbdc1Q9D0B6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pbdc1Q9D0B6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pbdc1Q9D0B6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pbdc1Q9D0B6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pbdc1Q9D0B6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pbdc1Q9D0B6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pbdc1Q9D0B6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pbdc1Q9D0B6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pbdc1Q9D0B6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pbdc1Q9D0B6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pbdc1Q9D0B6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pbdc1Q9D0B6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pbdc1Q9D0B6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pbdc1Q9D0B6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pbdc1Q9D0B6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pbdc1Q9D0B6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pbdc1Q9D0B6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pbdc1Q9D0B6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pbdc1Q9D0B6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Pbdc1Q9D0B6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pbdc1Q9D0B6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pbdc1Q9D0B6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pbdc1Q9D0B6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pbdc1Q9D0B6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pbdc1Q9D0B6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Pbdc1Q9D0B6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pbdc1Q9D0B6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pbdc1Q9D0B6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pbdc1Q9D0B6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pbdc1Q9D0B6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pbdc1Q9D0B6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pbdc1Q9D0B6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pbdc1Q9D0B6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pbdc1Q9D0B6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pbdc1Q9D0B6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Pbdc1Q9D0B6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pbdc1Q9D0B6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pbdc1Q9D0B6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pbdc1Q9D0B6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pbdc1Q9D0B6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pbdc1Q9D0B6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pbdc1Q9D0B6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pbdc1Q9D0B6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pbdc1Q9D0B6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pbdc1Q9D0B6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pbdc1Q9D0B6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pbdc1Q9D0B6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pbdc1Q9D0B6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pbdc1Q9D0B6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pbdc1Q9D0B6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pbdc1Q9D0B6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pbdc1Q9D0B6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pbdc1Q9D0B6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pbdc1Q9D0B6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pbdc1Q9D0B6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Pbdc1Q9D0B6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pbdc1Q9D0B6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pbdc1Q9D0B6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pbdc1Q9D0B6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pbdc1Q9D0B6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pbdc1Q9D0B6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pbdc1Q9D0B6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pbdc1Q9D0B6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pbdc1Q9D0B6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Pbdc1Q9D0B6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pbdc1Q9D0B6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pbdc1Q9D0B6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pbdc1Q9D0B6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pbdc1Q9D0B6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pbdc1Q9D0B6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pbdc1Q9D0B6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pbdc1Q9D0B6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pbdc1Q9D0B6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pbdc1Q9D0B6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pbdc1Q9D0B6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pbdc1Q9D0B6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Pbdc1Q9D0B6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pbdc1Q9D0B6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pbdc1Q9D0B6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pbdc1Q9D0B6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pbdc1Q9D0B6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pbdc1Q9D0B6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pbdc1Q9D0B6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms