Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYZ8

Ssbp2, Single-stranded DNA-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp2Q9CYZ8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssbp2Q9CYZ8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssbp2Q9CYZ8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssbp2Q9CYZ8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ssbp2Q9CYZ8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ssbp2Q9CYZ8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ssbp2Q9CYZ8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ssbp2Q9CYZ8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ssbp2Q9CYZ8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ssbp2Q9CYZ8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssbp2Q9CYZ8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssbp2Q9CYZ8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssbp2Q9CYZ8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssbp2Q9CYZ8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssbp2Q9CYZ8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssbp2Q9CYZ8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssbp2Q9CYZ8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssbp2Q9CYZ8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssbp2Q9CYZ8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssbp2Q9CYZ8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssbp2Q9CYZ8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssbp2Q9CYZ8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssbp2Q9CYZ8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssbp2Q9CYZ8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssbp2Q9CYZ8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssbp2Q9CYZ8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssbp2Q9CYZ8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssbp2Q9CYZ8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssbp2Q9CYZ8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssbp2Q9CYZ8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssbp2Q9CYZ8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssbp2Q9CYZ8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssbp2Q9CYZ8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssbp2Q9CYZ8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssbp2Q9CYZ8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssbp2Q9CYZ8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssbp2Q9CYZ8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssbp2Q9CYZ8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssbp2Q9CYZ8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssbp2Q9CYZ8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssbp2Q9CYZ8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssbp2Q9CYZ8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssbp2Q9CYZ8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssbp2Q9CYZ8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssbp2Q9CYZ8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssbp2Q9CYZ8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssbp2Q9CYZ8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssbp2Q9CYZ8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssbp2Q9CYZ8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssbp2Q9CYZ8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssbp2Q9CYZ8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssbp2Q9CYZ8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssbp2Q9CYZ8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssbp2Q9CYZ8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssbp2Q9CYZ8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssbp2Q9CYZ8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssbp2Q9CYZ8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssbp2Q9CYZ8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssbp2Q9CYZ8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssbp2Q9CYZ8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms