Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYW4

Hdhd3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd3Q9CYW4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hdhd3Q9CYW4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdhd3Q9CYW4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdhd3Q9CYW4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdhd3Q9CYW4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdhd3Q9CYW4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdhd3Q9CYW4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdhd3Q9CYW4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdhd3Q9CYW4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdhd3Q9CYW4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdhd3Q9CYW4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdhd3Q9CYW4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdhd3Q9CYW4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdhd3Q9CYW4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdhd3Q9CYW4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdhd3Q9CYW4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdhd3Q9CYW4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdhd3Q9CYW4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdhd3Q9CYW4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdhd3Q9CYW4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdhd3Q9CYW4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdhd3Q9CYW4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdhd3Q9CYW4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdhd3Q9CYW4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdhd3Q9CYW4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdhd3Q9CYW4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdhd3Q9CYW4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdhd3Q9CYW4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdhd3Q9CYW4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdhd3Q9CYW4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdhd3Q9CYW4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdhd3Q9CYW4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdhd3Q9CYW4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdhd3Q9CYW4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdhd3Q9CYW4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdhd3Q9CYW4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdhd3Q9CYW4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdhd3Q9CYW4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdhd3Q9CYW4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdhd3Q9CYW4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdhd3Q9CYW4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdhd3Q9CYW4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdhd3Q9CYW4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdhd3Q9CYW4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdhd3Q9CYW4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdhd3Q9CYW4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdhd3Q9CYW4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdhd3Q9CYW4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdhd3Q9CYW4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdhd3Q9CYW4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdhd3Q9CYW4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdhd3Q9CYW4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdhd3Q9CYW4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdhd3Q9CYW4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdhd3Q9CYW4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdhd3Q9CYW4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdhd3Q9CYW4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdhd3Q9CYW4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdhd3Q9CYW4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdhd3Q9CYW4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdhd3Q9CYW4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdhd3Q9CYW4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdhd3Q9CYW4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdhd3Q9CYW4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdhd3Q9CYW4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdhd3Q9CYW4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdhd3Q9CYW4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdhd3Q9CYW4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdhd3Q9CYW4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdhd3Q9CYW4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdhd3Q9CYW4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdhd3Q9CYW4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdhd3Q9CYW4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdhd3Q9CYW4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdhd3Q9CYW4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdhd3Q9CYW4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdhd3Q9CYW4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdhd3Q9CYW4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdhd3Q9CYW4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdhd3Q9CYW4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdhd3Q9CYW4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdhd3Q9CYW4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdhd3Q9CYW4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdhd3Q9CYW4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdhd3Q9CYW4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdhd3Q9CYW4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdhd3Q9CYW4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdhd3Q9CYW4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdhd3Q9CYW4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdhd3Q9CYW4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdhd3Q9CYW4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdhd3Q9CYW4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdhd3Q9CYW4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdhd3Q9CYW4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdhd3Q9CYW4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdhd3Q9CYW4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdhd3Q9CYW4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdhd3Q9CYW4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdhd3Q9CYW4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdhd3Q9CYW4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms