Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rrs1Q9CYH6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rrs1Q9CYH6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rrs1Q9CYH6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rrs1Q9CYH6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rrs1Q9CYH6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rrs1Q9CYH6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rrs1Q9CYH6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rrs1Q9CYH6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rrs1Q9CYH6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rrs1Q9CYH6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rrs1Q9CYH6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rrs1Q9CYH6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rrs1Q9CYH6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rrs1Q9CYH6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rrs1Q9CYH6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Rrs1Q9CYH6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rrs1Q9CYH6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Rrs1Q9CYH6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rrs1Q9CYH6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rrs1Q9CYH6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rrs1Q9CYH6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rrs1Q9CYH6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rrs1Q9CYH6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rrs1Q9CYH6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rrs1Q9CYH6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rrs1Q9CYH6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rrs1Q9CYH6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rrs1Q9CYH6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rrs1Q9CYH6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rrs1Q9CYH6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rrs1Q9CYH6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rrs1Q9CYH6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rrs1Q9CYH6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rrs1Q9CYH6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rrs1Q9CYH6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rrs1Q9CYH6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rrs1Q9CYH6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rrs1Q9CYH6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rrs1Q9CYH6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rrs1Q9CYH6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rrs1Q9CYH6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rrs1Q9CYH6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rrs1Q9CYH6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rrs1Q9CYH6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rrs1Q9CYH6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rrs1Q9CYH6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rrs1Q9CYH6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rrs1Q9CYH6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rrs1Q9CYH6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rrs1Q9CYH6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rrs1Q9CYH6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rrs1Q9CYH6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rrs1Q9CYH6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Rrs1Q9CYH6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rrs1Q9CYH6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rrs1Q9CYH6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rrs1Q9CYH6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rrs1Q9CYH6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rrs1Q9CYH6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rrs1Q9CYH6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rrs1Q9CYH6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rrs1Q9CYH6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rrs1Q9CYH6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rrs1Q9CYH6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Rrs1Q9CYH6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rrs1Q9CYH6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rrs1Q9CYH6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rrs1Q9CYH6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rrs1Q9CYH6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rrs1Q9CYH6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rrs1Q9CYH6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rrs1Q9CYH6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rrs1Q9CYH6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rrs1Q9CYH6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rrs1Q9CYH6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rrs1Q9CYH6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rrs1Q9CYH6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rrs1Q9CYH6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rrs1Q9CYH6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rrs1Q9CYH6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rrs1Q9CYH6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rrs1Q9CYH6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rrs1Q9CYH6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rrs1Q9CYH6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rrs1Q9CYH6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rrs1Q9CYH6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rrs1Q9CYH6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rrs1Q9CYH6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rrs1Q9CYH6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rrs1Q9CYH6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rrs1Q9CYH6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rrs1Q9CYH6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rrs1Q9CYH6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Rrs1Q9CYH6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Rrs1Q9CYH6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rrs1Q9CYH6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rrs1Q9CYH6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rrs1Q9CYH6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rrs1Q9CYH6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88 ms